Если вируса нет, а в ПАП-тесте указано «NILM», тестирования раз в 3 года будет совершенно достаточно.
О рекомендациях, как подготовиться к сдаче ПЦР-теста на COVID-19
Бедняга Муллис и его последователи сначала использовали тупо три водяных бани с разной температурой, вручную перемещая из одной в другую ценные пробирки с реакцией. Мы на практике в универе почему-то делали так же... Но как только мир понял, что ПЦР - это офигенно, сразу появились лабораторные приборы, которые этот процесс автоматизируют. Фактически это просто нагревательный блок, способный очень точно держать температуру в течение заданного времени и быстро его менять. Сейчас их на рынке пруд пруди, на любой вкус и цвет, чуть ли не кофе умеют готовить.
Но как нам это все помогает при анализах на вирус? Вот такой милаха прогонит ПЦР за полчасика Медицинское применение. Причем ее может быть изначально очень мало, но цепной характер реакции позволит нам ее приумножить. Но если изначально целевой ДНК в пробе нет, то и реакция не пройдет.
Добавляем полимеразу и праймеры, которые сядут именно и только на определенное место в ДНК какого-то интересующего нас патогена ДНК патогена ведь сильно отличается от нашей. Запускаем реакцию и смотрим, прошла она или нет! Если прошла - значит, пациент был заражен этим патогеном, а на нет и суда нет. Получился очень точный, быстрый и относительно дешевый метод выявления патогенов - прикиньте, раньше пока анализ на какую-нибудь бактерию высеешь на питательную среду, дождешься, чтобы оно подросло, определишь, что выросло - несколько дней пройдет.
А тут готовый результат за пару часов! Осталось только подобрать такие праймеры, чтобы они садились "отжигались" действительно только на ДНК патогена, а не на человеческую ДНК. Этот трудоемкий процесс и называется созданием тест-системы - наверняка слышали такое словосочетание в новостях! Этим занимаются, как правило, крупные компании, вкладывающие в этот процесс большие деньги и время.
Но тут что хорошо - один раз подобрал такие праймеры - и все, дальше любой лаборант с минимальным опытом сможет провести сам анализ. Дальнейшее развитие ПЦР пошло по пути ответа на вопрос "прошла реакция или нет? Логичным ответом на него стала ПЦР в реальном времени англ.
Кроме того, генотипирование даёт возможность посмотреть, в каком состоянии находится печень больного. Например, накапливание в печени жира указывает на то, что пациент страдает от 3 генотипа вируса. Анализ крови на данной стадии показывает цифру, которая характеризует генотип. Изредка случается, что определить генотип не получается, и в ответах из лаборатории указано «не типируется». Это означает, что человек страдает от генотипа, нераспространенного в этой географической зоне. Чтобы обнаружить его, придётся сдать анализ еще раз, но с той системой диагностики, которая сможет его распознать. Считается, что наибольшее внимание следует уделить второму пункту, так как исходя из этих показателей, можно сделать прогноз, определить продолжительность лечения и его тип.
Несмотря на понятность анализа, нельзя самостоятельно ставить себе диагноз и заниматься самолечением, результаты анализа нужно показать лечащему врачу. Как подготовиться к сдаче анализа Для того чтобы получить достоверный результат, важно соблюсти ряд правил: Сдавать анализы стоит утром натощак постараться поесть в последний раз минимум за 8 часов до процедуры. Нельзя перед сдачей крови пить что-то, кроме воды. За два дня нужно исключить жирные и жареные продукты, а также алкоголь. Минимум за час лучше отказаться от сигарет. Не рекомендуется сдавать анализы после массажа, УЗИ или рентгена. За день до обследования пациент должен отказаться от медицинских препаратов, физической активности и эмоциональных нагрузок. Полчаса перед обследованием стоит провести спокойно и расслаблено.
Как проводится тестирование и как к нему подготовиться? Каждое тестирование требует определенной подготовки, иначе точность результатов будет снижена. Для анализа берут кровь из вены, сдавать следует в утренние часы натощак. В рамках личной безопасности, обследуемый должен следить, чтобы шприц был стерилен. Кровь из вены пациента берется в незначительном количестве, поэтому на состоянии процедура никак не сказывается. После сдачи ПЦР пациент может отправляться домой. ПЦР является очень важным диагностическим тестом. Показатели лабораторного тестирования говорят о том, насколько точно можно определить наличие вируса в крови пациента. Такой широкий разброс помогает определить заболевание на любой его стадии. Это позволяет точно определить стадию заболевания и уровень вирусной нагрузки.
Для выявления и идентификации достаточно нескольких фрагментов ДНК возбудителей в исследуемом биологическом материале. Когда проводится анализ? ПЦР получила широкое распространение в различных областях практической медицины. Исследование является одним из основных методов диагностики различных инфекционных заболеваний с половым путем передачи. К ним относятся патологические процессы, вызванные: вирусами герпетическая, папилломавирусная инфекция , ВИЧ СПИД, вирусные гепатиты с парентеральным путем передачи специфическими бактериями сифилис, гонорея, микоплазмоз, уреаплазмоз, хламидиоз простейшими трихомониаз Полимеразная цепная реакция также может использоваться для диагностики инфекций, вызванных условно-патогенными грибами кандидоз.
Что такое анализ крови на ПЦР, и зачем он нужен
Мюллис и его группа разработчиков подали заявку на патент, который утвердили 28 июля 1987 года. В том же 1985-м в Cetus начали использовать для ПЦР термостабильную Taq-полимеразу, что значительно упростило работу: раньше перед каждым новым синтетическим циклом в смесь надо было добавлять новую порцию фермента, потому что он быстро выходил из строя от высоких температур. Cycle рис. Рисунок 4. Cycle — первый прототип ПЦР-амплификатора. Остальные члены его группы получили по символическому доллару. Это обострило и так напряженные отношения в коллективе. Осенью Мюллис покинул компанию [13]. После ухода из Cetus он два года возглавлял молекулярно-биологический отдел в Xytronyx, а в 1992-м открыл компанию по продаже ювелирных изделий с амплифицированной ДНК знаменитостей — Элвиса Пресли, Мэрилин Монро и т. Его награждение — до сих пор больной вопрос для норвежского научного сообщества, где первооткрывателем метода считают Хьелля Клеппе. Сейчас Мюллису 72 года, он работает научным сотрудником Научно-исследовательского института детской больницы Окленда и с 2011 года возглавляет предприятие Altermune LLC, занимающееся изучением иммунитета [14].
Кэри Мюллис нередко выступает на конференциях, рассказывает о своей жизни, работе и, конечно, своем открытии см. Он — прекрасный рассказчик, его всегда интересно слушать. Видео 1. Однажды он рассказал о ночной встрече со светящимся зеленым енотом в лесу рядом со своим загородным домом. В 1998 году вышла книга Кэри Мюллиса «Танец обнаженного разума» Dancing naked in the mind field , где в обрамлении автобиографических историй ученый высказывает своё мнение о глобальном потеплении, СПИДе и других волнующих общество вопросах. Мюллис верит в астрологию и считает, что значительного изменения климата не происходит, между ВИЧ и СПИДом нет никакой связи, а все исследования, говорящие об обратном, — плоды заговора ученых-карьеристов с правительствами их стран. Компания Cetus подала патентную заявку на метод ПЦР с Taq-полимеразой, и ее одобрили в октябре 1990 года. Журнал Science объявил Taq-полимеразу молекулой года, а статья сотрудников Cetus о ПЦР с ее использованием [15] несколько лет поддерживала статус самой цитируемой биологической публикации [16]. В августе химический гигант DuPont подал против Cetus иск, в котором утверждал, что патенты на ПЦР получены неправомерно, поскольку этот процесс еще в 1970-х описал Хьелль Клеппе. Но через год объявило, что они останутся действительными: комиссия нашла метод, описанный в работе Клеппе, слишком «неопределенным и сомнительным».
К тому же там не упоминалась возможность экспоненциальной репликации — отличительной черты ПЦР. В суде представители DuPont так и не смогли доказать вторичность изобретения Мюллиса. С этой сделки Cetus выплатила Кэри Мюллису неоправданно малую сумму, фактически ограбив его. Принцип метода Все мы знаем, что ДНК — это двухцепочечная молекула, где каждая цепочка состоит из звеньев-нуклеотидов. Нуклеотиды составлены из трех молекул: остатка фосфорной кислоты, сахара и азотистого основания. Если сахар и фосфат одинаковы у всех нуклеотидов в ДНК в РНК сахар другой , то азотистых оснований четыре если не считать редкие модификации : аденин, тимин, цитозин и гуанин, обозначаемые А, Т, Ц и Г соответственно. В молекулах РНК тимин заменен урацилом. Нуклеотиды соединяются в цепочку, образуя связи между фосфатной группой одного нуклеотида и гидроксильной — другого. Чтобы молекула была стабильной, цепочки должны как-то взаимодействовать друг с другом. Это обеспечивают водородные связи , образующиеся между азотистыми основаниями противоположных цепей по принципу комплементарности : А соединяется только с Т или У в РНК , а Г — с Ц рис.
И поэтому, имея одну цепь ДНК, в соответствии с этим правилом легко построить ее пару. Собственно, на этом и основана ПЦР. Рисунок 5.
В группе вирусов с низким риском — 6, 11, 42, 44, 43. Полученные результаты не дифференцируются по штаммам. Ошибки при нахождении штамма практически исключены. Концентрация обозначается в других единицах, нежели в анализе ПЦР — не в геном-эквивалентах, а в относительных единицах они отражают отношение количества копий вируса к значению, которое считается пороговым. Положительным считается результат, превышающий 1 относительную единицу. В отличие от ПЦР-анализа, ответы Digene-теста клиники готовят в течение 10 дней.
Если получен результат ниже количественно значимого порога, будет выдан ответ «не обнаружено». Поэтому результаты дайджен-теста и качественного ПЦР-анализа, в котором даже минимальное количество вируса считается положительным результатом, могут быть противоположными. Врачи рекомендуют проходить digene-тест, поскольку при прочих равных он выгоднее в финансовом плане — после получения результатов не придется отдельно проводить количественный анализ. Подготовка к анализам Как уже говорилось, и в ПЦР-анализе, и в дайджин-тесте используется генетический материал. Для его получения необходимо выполнить забор клеток эпителия из урогенитального тракта. Обычно у женщин берут соскоб из цервикального канала, у мужчин — из уретры. Иногда используется материал из прямой кишки, полости рта — при наличии там новообразований. В отличие от многих других ПЦР-анализов, при исследовании ВПЧ не используют кровь, поскольку вирус в ней практически не обнаруживается. Рекомендации для женщин: Чтобы получить достоверные результаты, женщине рекомендуют сдавать анализ не раньше чем через 5 дней после начала менструального цикла и не позже чем за пять дней до его окончания.
Первым днем цикла считается первый день менструации. Оптимальное время сдачи анализа — первая половина цикла; За сутки до проведения исследования и в тот же день исключаются интимные контакты, спринцевания, использование интравагинальных лекарственных и контрацептивных средств; УЗИ органов малого таза с использованием интравагинального датчика, кольпоскопию и соскоб разносят во времени на 3-4 дня. Рекомендации для мужчин: не мочиться за 2-3 часа до соскоба из уретры; отказаться от интимных контактов за 2 суток; общие рекомендации: закончить прием антибиотиков перорально или в виде инъекций за месяц до обследования; прекратить лечение с помощью местных антибактериальных или антисептических средств за 2 недели до обследования; в день обследования не мыть половые органы с использованием антибактериального мыла или геля. Все это относится к плановой сдаче анализов, но если при обращении к врачу обнаружены патологические изменения, соскоб берут сразу же, без подготовки. Процедура забора материала У женщин клетки эпителия берут на гинекологическом кресле с помощью одноразовой цитологической щеточки, которую вводят в цервикальный канал на 1-1,5 см, несколько раз прокручивают вокруг оси, затем аккуратно вынимают так, чтобы не загрязнить материал вагинальными выделениями. Это безболезненная и быстрая процедура. Мужчине в уретру вводят специальный зонд, всего на 3-4 см, так что болевых ощущений тоже не будет. Затем зонд или щеточку опускают в пробирку с жидкостью, прополаскивают, отжимают о стенки, вынимают. Пробирку закупоривают и отправляют в лабораторию.
Стоимость забора материала в клиниках в среднем составляет 400 руб. Эту сумму прибавляют к сумме за само исследование. Сроки проведения анализов Первично анализ на ВПЧ рекомендуется сдать в следующих ситуациях: при плановом гинекологическом осмотре женщины старше 30 лет если результата будет отрицательным, анализ рекомендуется сдавать каждые три года ; при получении сомнительного цитологического мазка ПАП-теста ; после обнаружения на осмотре остроконечных кондилом, диспластических изменений шейки матки. Если у женщины старше 30 лет анализ на онкогенный штамм ВПЧ положительный, это может означать, что инфекция персистирует, и иммунитет не может уничтожить возбудителя. До этого возраста опасность невелика — обычно повторные анализы оказываются «чистыми». Когда наряду с положительным анализом присутствуют изменения в цитологическом мазке, это значит, что риск развития онкологической патологии высок. В этом случае рекомендуется пройти расширенную кольпоскопию с биопсией шейки матки. Одновременно назначается противовирусная терапия. Повторные анализы рекомендуется сдавать в той же лаборатории, где и первичный.
Так удобнее сравнивать результаты. Перед беременностью анализ на ВПЧ необязателен.
Этот вариант диагностики позволяет обнаружить вирус на его начальной стадии, даже если у пациента еще нет признаков и симптомов болезни. Антитела, в свою очередь, это ответная реакция организма на коронавирус. Результат теста на антитела IgG и IgM позволяет понять, на какой именно фазе заболевания находится пациент, а также помогает определить, была ли перенесена инфекция в прошлом. Если Вы хотите максимально точно определить болеете ли Вы, на какой стадии заболевания находитесь или же понять, было ли заболевание в прошлом, то лучшим вариантом будет сдача не только ПЦР-теста, но и теста на антитела.
В совокупности, результаты этих тестов дадут самый четкий и информативный результат. Для того, чтобы понять, что означают те или иные результаты, необходимо рассмотреть каждый случай по отдельности: ПЦР — отрицательный, IgG — положительный, IgM — отрицательный. На данный момент, вирус в Вашем организме не выявлен.
Также концентрация влияет на успешность назначаемого лечения. Норма количественного анализа Нормальным результатом количественного анализа на гепатит С для здорового человека считается полное отсутствие вируса в крови. На это должен указать качественный анализ, он проводится пациентам, у которых обнаружены антитела к вирусу. Нормой при расшифровке анализов на гепатит С считается — «вирус не обнаружен». Читайте также: Масло орегано против грибка — основные показания, дозировка и применение Если количественный анализ с расшифровкой показал результат меньше 400 тыс. Нагрузку более 800 тыс. Однако среди специалистов нет согласия в определении минимальной и максимальной концентраций. Границей считают 400 тыс. Вероятность ошибочного результата Получение ошибочного результата возможно. Это может быть объяснено несколькими причинами.
Суть анализа ПЦР на гепатит В и его результаты
В зависимости от целей, преследуемых в ходе исследования, доктор назначает конкретный тип теста. Существуют следующие разновидности ПЦР: Качественный. При назначении диагностических тестов, у пациентов возникает вопрос, что показывает подобный метод исследования. Качественный анализ способом ПЦР — высокочувствительный тест, определяющий наличие РНК вируса в крови в минимальной концентрации. Обычно подобная разновидность полимеразной цепной реакции ставится по технологии обратной транскрипции. Проведение исследования возможно только одним способом — методом real-time. В ходе подготовки материала к постановке ПЦР в образец добавляют краситель. После каждого цикла амплификации проводится автоматизированное количественное исследование в режиме реального времени. Нередко методику проводят в сочетании с обратной транскрипцией. Таким образом возможно качественное определение малого количества копий РНК вируса.
Анализ сдается проводится на конечной стадии диагностического процесса. Принцип исследования построен на разнице в последовательности нуклеотидов, что отличает один генотип вируса гепатита С от другого. Обычно анализ делают методом мультипраймерной мультиплексной ПЦР. При подозрении на носительство вируса, необходимо выполнить качественную ПЦР. Если результат отрицательный, человек скорее всего здоров. Но для полного исключения заражения рекомендуют повторить исследование через 7—10 дней. Если же РНК вируса обнаружена, проводят дальнейшие тесты количественный и генотипирование. Показания к проведению лабораторного теста Основным показанием к сдаче крови на гепатит С методом полимеразной цепной реакции является положительный результат иммуноферментного анализа вне зависимости от разновидности: Total, дифференцированный тест на IgG и IgM. Кроме того, провериться нужно: в период беременности тест делают дважды — в первом триместре и за 7—10 недель до родов ; при работе, связанной с повышенным риском инфицирования медсестры, лаборанты, работники донорских центров, косметологи и т.
Рост заболеваемости растет с каждым годом. Поэтому для раннего выявления инфекции лабораторные тесты на HCV рекомендуют сдавать один раз в год. Где сдать анализ При обращении в поликлинику, пациент имеет право на бесплатные анализы. Но сначала сдают тест ИФА. И только при положительном либо сомнительном результате показано исследование методом ПЦР. Поэтому провести срочную диагностику можно обратившись в платную лабораторию, где сдать кровь на ПЦР можно в удобное для пациента время. Одновременно рекомендуют сразу проверить показатели печеночных ферментов, стандартные клинические параметры крови. Как правило, изучение крови методом ПЦР доступно практически в любой лаборатории. Если пункт забора крови не оснащен должным оборудованием, биологический материал транспортируют для проведения исследования с соблюдением температурного режима и других условий.
Проведение ПЦР в поликлинике возможно только после других обследований, результаты которых косвенно укажут на наличие гепатита С. Как правильно сдавать кровь Перед тем, как сдавать кровь на обнаружения возможного вируса, следует соблюсти ряд правил подготовки к анализу. Основные аспекты указаны в памятке: За 5—7 дней отказаться от потребления жирной, жареной пищи, алкоголя. За 12—14 часов до проведения исследования не есть.
Это значит, что выявить признаки заражения можно даже в том случае, если количество возбудителя в биологическом материале будет минимальным. Подобная особенность дает возможность постановки диагноза даже в период инкубации, когда симптомы еще полностью отсутствуют.
Однако осечка возможна и при применении ПЦР методики. Это происходит, например, если пороговая концентрация все же не успела достичь определяемых тестом значений. В этом случае велика вероятность получения далеких от правды результатов. Как отмечают доктора, ничего сложного во внешнем виде бумаги нет. Зачастую на документе можно обнаружить название искомого возбудителя. А напротив него пометку «обнаружен» или «не обнаружен».
В первом случае пациенту рекомендуется озаботиться собственным здоровьем. Так как анализ расценивается как положительный, а человек, как зараженный. Следовательно, ему требуется терапия. Во втором случае чаще всего состояние пациента оценивают, как здоровое, хотя могут быть и исключения. Важно помнить, что количество возбудителей, указанных на бланке, зависит во многом от того, какое конкретно вид анализа применялся. Если проводился поиск только одного патогенного микроорганизма, в результате будет фигурировать только его название с соответствующей пометкой.
Если ПЦР проводилось сразу на несколько инфекций, что тоже возможно, в бланке будет список патологий с пометками. Сегодня в лабораториях при комплексном анализе на группу инфекций не принято выдавать на каждый патогенный микроорганизм отдельный бланк. Их все указывают на одном листе. Вероятность ошибочных итогов при ПЦР Часто пациенты интересуются вопросом о том, возможно ли получение ложных результатов обследования при использовании методики. К сожалению, как отмечают врачи, ошибки хоть и редко, но случаются. Существует, например, вероятность получить ложноположительные результаты ПЦР сразу после лечения.
Объясняется это очень просто. Терапия уже окончена, возбудитель удален из организма и не может заражать новые ткани. В этом случае тест-система будет улавливать их и воспринимать за полноценную патологию, выдавая ложноположительный итог. Именно поэтому рекомендуется после терапии сдавать исследование несколько раз с разными промежутками времени. Только в этом случае итоги будут достаточно объективными. Ложноотрицательные результаты анализов ПЦР после приема антибиотиков также возможны.
Фермент, отличающийся устойчивостью и структурной стабильностью на фоне изменений температуры, необходимых для правильного протекания химической реакции. Смесь протеинов. Для построения дополнительных участков РНК необходим «строительный материал», для чего к биологическому образцу добавляют определенные соединения белковой структуры. Смесь, поддерживающая оптимальный уровень рН для обеспечения протекания полимеразной цепной реакции. При некоторых способах постановки ПЦР дополнительно используются РНК-зонды и другие внутренние контроли, используемые в качестве контрольных образцов при выявлении результатов. Сам процесс увеличения участков вирусной РНК при помощи матрицы именуют амплификацией. Реакция протекает в несколько этапов: Денатурирование. Процесс «раскручивания» нитей РНК обеспечивается повышением температуры до определенного уровня.
После снижения температуры до необходимых показателей происходит присоединение праймеров к РНК. Данная стадия возможна только при наличии в образце крови искомых вирусных частиц. Непосредственный синтез участков вирусной РНК с участием ферментов. Перечисленные циклы постановки ПЦР повторяются несколько десятков раз, что обеспечивает многократное увеличение количества участков РНК возбудителя гепатита С уровня, определяемого лабораторными способами. Перед проведением анализа образец забора крови соответствующим образом подготавливается. Содержащиеся РНК адсорбируются на буфере-носителе, затем смываются и используется для постановки полимеразной цепной реакции. Детекция результатов проводится либо методом электрофореза горизонтального или вертикального , либо способом гибридизации. Способ расшифровки результатов реакции выбирается исходя из целей проведения исследования просто выявление РНК, либо определение ее ориентировочного количества.
ПЦР — самый точный анализ крови на гепатит С Перечень предлагаемых исследований на HCV включает несколько пунктов, отличающихся по стоимости, срокам готовности и способу выполнения. Если обратиться к протоколам Всемирной организации здравоохранения ВОЗ , порядок диагностики инфекции включает несколько последовательных этапов. Для начала сдают: общий анализ крови и мочи; биохимия крови; исследование на содержание глюкозы строго натощак ; анализ на ВИЧ; флюорография; иммунограмма при подозрении на наличие аутоиммунных патологий. При отклонении показателей биохимического анализа крови от физиологической нормы пациенту назначают тест, основанный на обнаружении специфических антител, вырабатываемых при контакте вируса с кровью ИФА. Но подобный анализ крови на гепатит С имеет существенный недостаток. Процесс синтеза антител зависит от функционирования и выработки иммунокомпетентных клеток. Индивидуальные особенности организма могут стать причиной как ложноотрицательного, так и ложноположительного ответа. Перед назначением теста ИФА врач рассказывает пациенту о возможной ошибке, что вызывает ответный вопрос: «Какой анализ крови показывает гепатит С с минимальным риском получения неверных результатов?
Дальнейшая тактика действий зависит от того, что покажет исследование. В случае подтверждения диагноза, пациенту сразу же назначают гепатопротекторы, предупреждают о важности правильного питания и здорового образа жизни. Но таргетная терапия невозможна без определения уровня вирусной нагрузки и генотипа гепатита С. Некоторые лекарственные препараты могут спровоцировать обострение гепатита В. Поэтому для исключения осложнений, дополнительно назначают анализы на HBsAg. HCV лечат только после получения отрицательного результата исследования. Виды: качественный, количественный и генотипирование При первичной диагностике гепатита С серологическим методом определяется титр вырабатываемых антител. Такой результат приблизительно показывает активность патологического процесса.
Другие виды исследования могут оказаться ложноотрицательными из-за того, что в образце недостаточно много вирусов или бактерий или организм не успел выработать достаточное количество антител. ПЦР-анализ проводится на образце одного из следующих видов биоматериала: кровь, слюна, слизь, ткань, гной, мокрота, моча. Этот процесс называется ПЦР с обратной транскрипцией. Обнаружение вирусной РНК с помощью ПЦР позволяет обеспечить диагностику COVID-19 на ранней стадии - до того, как организм выработает ответ в виде антител или даже до того, как у человека появятся симптомы заболевания. Тесты ПЦР играют решающую роль в предотвращении распространения заболеваний, так как часто позволяют выявить инфекции на ранней стадии, еще до появления симптомов. Количественный ПЦР-анализ позволяет оценить инфекционную нагрузку на организм, а также используется для анализа изменений экспрессии генов в опухолях. Важна также и высокая скорость проведения исследования.
В отличие от традиционного посева при выявлении бактериальных инфекций, который занимает несколько дней, ПЦР тест обычно выполняется в течение суток. Это значительно увеличивает вероятность назначения своевременного лечения. Кроме того, с помощью ПЦР можно определить латентных носителей инфекции. Необходимо строго соблюдать правила сбора биоматериала и его хранения. Важно выбрать правильное время взятия биоматериала и выполнить правила подготовки к тесту.
ПЦР: сверхчувствительная диагностика инфекций
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – высокоточный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет выявить у человека различные инфекционные и наследственные заболевания, как в острой и хронической стадии, так и задолго до того. Подробное описание: что такое ПЦР-тест на ковид, что показывает и как узнать результат. Как проводится забор биоматериала, как подготовиться. Аббревиатура ПЦР обозначает полимеразная цепная реакция. ПЦР-тест позволяет определить наличие вируса папилломы, а также его тип и степень угрозы для здоровья. метод применяется в медицине, биологии, ветеринарии, криминалистике, санитарной службе и других отраслях деятельности человека. Расшифровка результатов ПЦР-анализа на папилломавирус, Digene-теста и их разновидностей не отличаются, поскольку количество микроорганизмов и их тип не зависит от метода обнаружения.
Цели обследования
- История метода
- ПЦР-тесты: для чего нужен, как сдавать анализ, цена, можно ли верить результатам
- ПЦР анализ – что это такое, как делают ПЦР анализ крови.
- Наименование метода
Что значит ПЦР РНК анализ гепатита С?
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – высокоточный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет выявить у человека различные инфекционные и наследственные заболевания, как в острой и хронической стадии, так и задолго до того. Дайджин-тест более простой в выполнении, чем ПЦР-анализ, и вместе с этим отличается высочайшей надежностью. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — метод молекулярной биологии. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) является «золотым стандартом» диагностики вирусного гепатита С. Высокая чувствительность теста позволяет выявлять генетический материал вирусов (РНК) даже если их в исследуемом материале единицы.
ПЦР-тестирование: как работает метод ПЦР в диагностике
При выборе типа биоматериала для диагностики врачи ориентируются на специфику инфекции, на её излюбленную локализацию. Ведь от того, попадет ли вредоносная ДНК в пробу, зависит то, будет ли получен достоверный результат анализа. Для ПЦР берутся следующие материалы: Мазок или эпителиальный соскоб со слизистых оболочек. Это может быть уретра, влагалище, шейка матки, цервикальный канал, задний проход, ротовая, носовая и даже глазная полость. Мазки наиболее актуальны при диагностике заболеваний, передающихся половым путём. Для взятия мазка или соскоба используются зонды с разными наконечниками; Кровь из вены берут, когда нужно обнаружить ВИЧ, гепатит, цитомегаловирус, мононуклеоз или какое-либо заболевание бактериальной этиологии, например, сифилис, холеру или боррелиоз; Биологические жидкости моча, слюна, сперма, мокрота, секрет предстательной железы, желудочный сок, плевральная, суставная, спинномозговая или амниотическая жидкость, а также бронхоальвеолярный лаваж берутся по показаниям. Например, ПЦР-анализ мокроты используется при диагностике туберкулёза; Пунктаты и биоптаты органов и тканей, как правило, берутся при подозрении на онкологию. Исключение составляет биопсия желудка, которую проводят для определения наличия Helicobacter pylori — бактерии, вызывающей гастрит и язвенную болезнь. Хранение и транспортировка биоматериалов Пробы подлежат отправке в амплификатор не позднее, чем через 2 часа после забора, если они находятся в помещении при комнатной температуре.
После оттаивания они должны быть сразу использованы, повторное замораживание запрещено. В подавляющем большинстве случаев ПЦР-диагностика проводится «день в день»: пациент приходит в клинику, где у него берут мазок или кровь и сразу отправляют биоматериал в лабораторию, поэтому беспокоиться о правилах хранения не стоит. Как подготовиться к ПЦР-диагностике? Правила довольно просты: Мазок или соскоб из половых путей, как у мужчин, так и у женщин, сдается после 72-часового воздержания от сексуальных контактов, непосредственно перед забором нужно произвести туалет интимной зоны и 2-3 часа не мочиться. Прекрасной половине человечества не следует планировать визит в лабораторию во время менструации и сразу после неё, кроме того, запрещено использовать какие-либо средства, нарушающие естественное состояние микрофлоры влагалища спринцевания, свечи. Всем пациентам необходимо завершить антибактериальную терапию если таковая проводилась не позднее, чем за 2 недели до ПЦР-анализа; Кровь сдается из вены утром натощак; Мочу и сперму собирают в маленькие стерильные контейнеры, которые можно приобрести в аптеке, если процедура забора будет производиться дома. Но не забывайте о сроках хранения и транспортировки биоматериалов — максимум 2 часа; Слюну собирают после 3 часов воздержания от приёма пищи и напитков, допустимо только полоскать рот водой. Непосредственно перед забором рекомендуется помассировать область слюнных желёз.
В определении количественной ПЦР ключевым достижением стало создание флуоресцентных ДНК-зондов, добавляющихся в реакционную смесь одновременно с простыми праймерами и позволяют отслеживать во времени процесс ПЦР, то есть real-time-ПЦР. Под методологией TaqMan понимается синтез флуоресцентных ДНК-зондов, которые специфичны к средней части ампликона и имеют две метки на концах. Одной из них является флуоресцентная метка, вторая — молекула-гаситель данной флуоресценции. Особый прибор, представляющий собой гибрид флуориметра и термоблока-амплификатора, производит постоянные замеры в каждой пробирке флуоресценции принцип real-time-ПЦР. После 20-40 циклов ПЦР в результате для каждого образца будут получены индивидуальные кривые. Количество копий искомого гена, который содержится в исследуемом образце, может быть вычислено по калибровочным кривым с контрольными образцами. Также важной особенностью осуществления ПЦР флуоресцентным методом является то, что пробирки со смесью ПЦР нет необходимости открывать при учете результатов.
За счет этого снижается возможность заражения продуктами амплификации помещений, и необходимость в выделении особых рабочих областей для проведения электрофореза отпадает. Что показывает расшифровка количественной ПЦР? Что обнаруживается? Посредством такого метода, как количественная ПЦР, находят качественные изменения в генах: вставки, делеции и точковые мутации. Но при некоторых наследственных нарушениях соответствующие симптомы появляются в ответ на изменение содержания определенных генов. Это значит, что в одном миллилитре исследуемого образца найдено определенное количество копий РНК или ДНК возбудителя, измеряемое в международных единицах. В зависимости от величины диагностируется тяжесть инфекции.
Для установления вирусной нагрузки обычно исследуют кровь, поскольку вирусы при заболевании свободно двигаются в крови. Особенности Количественная ПЦР в анализе крови обладает двумя особенностями. Анализ проводится в присутствии праймеров или дезоксирибонуклеозидтрифосфатов, которые мечены посредством флуоресцентной или радиоактивной метки для точного определения содержания сформировавшегося продукта ПЦР. Связано это с тем, что на конечной стадии насыщения, когда становится очень много продуктов ПЦР, лимитирующими звеньями данной реакции выступают как сам фермент, так и субстраты. Окончание очередного цикла ПЦР в таких условиях уже не характеризуется удвоением количества продуктов ПЦР, нивелируются незначительные количественные отличия между различными пробами, довольно четко определяемыми на ранних этапах после прохождения ряда циклов реакции. Стоимость ПЦР-диагностики ПЦР-исследование имеет стоимость, которая зависит от того, какая именно инфекция будет проверена, от методики анализа и исследуемого материала. Чтобы определить одну инфекцию, придется отдать в пределах 200-800 рублей.
Также добавляется плата за взятие биоматериала — примерно 400 рублей. Результаты ПЦР диагностики Методика обладает сто процентной специфичностью, то есть в ходе анализа определяется именно запланированный возбудитель. В отличие от микроскопии мазков при данном исследовании нельзя принять один вид возбудителя за другой. Или спутать его с внешне похожими клетками, например, измененным эндотелием. Даже обломки нуклеиновых кислот, остающиеся после инфекционного агента по окончании терапии специфическими антибактериальными препаратами, будут давать положительные результаты анализов ПЦР. Для получения максимально достоверных результатов важен правильный забор биологического материала. Он должен исключать загрязнение инородными инфекционными агентами.
ПЦР положительный чаще всего фиксируется в период клинических симптомов разгара болезни. В случае носительства возбудителя, а также до трех-шести месяцев после проведения лечения и эрадикации возбудителя. Нередко встречается и ложноположительные результаты ПЦР сразу после лечения.
Биоматериал следует собрать в одноразовый стерильный контейнер. Его можно бесплатно получить в любом лабораторном отделении Гемотест. Инструкция по использованию контейнера Открутите крышку контейнера и положите её, не касаясь внутренней части крышки. Соберите первую порцию мочи в контейнер. Если мочу на анализ берут у ребёнка, можно использовать мочеприёмник. Закройте контейнер крышкой и плотно закрутите её. Доставьте контейнер в лабораторное отделение в течение 2 часов после взятия биоматериала.
Подготовка к ПЦР-анализу кала Кал следует сдавать до приёма антибиотиков или не ранее, чем через 12 часов после приёма препарата. За 72 часа до исследования откажитесь от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, а также прекратите приём препаратов, оказывающих влияние на работу кишечника и окраску кала. Соберите образец кала после естественного опорожнения кишечника без применения клизм или слабительных средств. Позаботьтесь о том, чтобы в биоматериал не попали посторонние примеси: вода, моча, выделения половых органов, дезинфицирующие средства и химические вещества, содержащиеся в подгузниках: перед дефекацией вымойте и высушите промежность; соберите кал с чистой и не впитывающей влагу поверхности: это может быть чистый пакет из полиэтилена, клеёнка, чистое судно или горшок. Собирать кал из унитаза, пелёнок или подгузников — нельзя! Поместите 1—2 чайные ложки биоматериала в герметичный контейнер.
Однако в случае с полимеразной цепной реакцией расшифровка результатов ПЦР исследований мало зависит от биологического материала, который брался у пациента. Гораздо большее значение имеет подготовка к обследованию с помощью метода. В качестве материала могут служить: кровь, сдаваемая в соответствии со стандартными рекомендациями из вены на локтевом сгибе мокрота, собираемая при откашливании налет с ротовой полости, собираемый доктором в утреннее время, пока пациент еще не завтракал и не чистил зубы мазок с половых органов, дающий хорошие результаты в том случае, если больной не мочился в течение нескольких часов, отказывался от сексуальных контактов несколько дней и соблюдал ряд других рекомендаций исследование мочи, при котором биоматериал также предпочтительно собирать с утра, не проводя накануне гигиену половых органов биоптаты органов или тканей, получаемые с помощью специальных инструментов и др.
Как отмечают врачи, материалом для ПЦР может быть совершенно любая жидкая среда организма человека. При выборе главное помнить о том, что предпочтение отдают той среде, где с большей долей вероятности будет присутствовать возбудитель. Например, при половых инфекциях целесообразнее брать мазок с половых органов или кровь, чем мазок из ротовой полости. Решать вопрос о том, какие материалы используются для получения результатов ПЦР в том или ином случае, лучше всего с лечащим врачом на приеме. Доктор сделает оптимальный выбор, исходя из предполагаемого у пациента заболевания. Предположим, доктор поставил себе цель обнаружить какой-то патогенный микроорганизм в теле пациента. И если тот на самом деле присутствует в теле, он будет обнаружен. При этом спутать его с каким-либо другим патогеном благодаря уникальному коду ДНК будет невозможно. Ведь методика рассчитана, в отличие от многих других диагностических методов, именно на поиск самих возбудителей, а не их следов.
Как отмечают доктора, при данном исследовании вероятность случайно принять один возбудитель за другой сводится к нулю. Зато существует вероятность получения положительных результатов после терапии. Если в организме будут оставаться обломки нуклеиновых кислот. Однозначно положительной реакция чаще всего бывает, если пациент предъявляет жалобы на какие-то конкретные симптомы инфекционного процесса. Причем результат будет сохраняться даже в течение нескольких месяцев после того, как возбудитель будет полностью побежден и удален из организма. Что значит отрицательный результат ПЦР Если ПЦР результат отрицательный, значительное число пациентов автоматически считают, что они здоровы. Это практически правильное решение. Ведь если итоги оказались отрицательными, значит фрагменты патогенного микроорганизма не были определены тест-системой. Из этого следует логичный вывод, что микроорганизма в теле нет.
Однако стоит учитывать, что несмотря на всю свою высокую чувствительность и специфичность, методика имеет определенный порог чувствительности. Если концентрация возбудителя на момент обследования не переходит границу этого порога, результат будет расцениваться, как отрицательные. Хотя на самом деле окажется ложным до поры до времени. Доктора акцентируют особое внимание на том, что отрицательный результат не всегда означает отсутствие патологии. Кто из докторов выполняет расшифровку результатов ПЦР Часто среди пациентов звучит вопрос о том, какой врач будет проводить расшифровку ПЦР исследования.
Чувствительность определения 60 МЕ/мл — что это значит?
В расшифровка анализа анализах ПЦР на гепатит С, полученных из лаборатории, обычно указывают определённые данные, и расшифровать их можно даже самостоятельно. Тест на коронавирус, проводимый через полимеразную цепную реакцию, позволяет определить, болеет обследуемый или нет. это определение вируса в мазке из ротоглотки методом ПЦР. Положительный результат ПЦР теста означает, что пациент в настоящее время инфицирован определенным патогеном. ПЦР, или полимеразная цепная реакция, представляет собой метод обнаружения инфекций.
Что такое ПЦР анализ
В отличие от традиционного посева при выявлении бактериальных инфекций, который занимает несколько дней, ПЦР тест обычно выполняется в течение суток. Это значительно увеличивает вероятность назначения своевременного лечения. Кроме того, с помощью ПЦР можно определить латентных носителей инфекции. Необходимо строго соблюдать правила сбора биоматериала и его хранения. Важно выбрать правильное время взятия биоматериала и выполнить правила подготовки к тесту. В частности, это касается и нового коронавируса, который присутствует в выделениях носоглотки и ротоглотки только в течение определенного времени, по истечении которого анализ окажется отрицательным. Кроме того, высокая чувствительность ПЦР может иногда превращаться из преимущества в недостаток.
Показания к проведению ПЦР-анализа ПЦР-тесты используются для: диагностики инфекционных заболеваний, вызванных вирусами, бактериями и грибами, в том числе для определения возбудителей ряда урогенитальных инфекций; определения патологических генетических нарушений; определения роста и развития раковых клеток. ПЦР тест также можно использовать для прямой диагностики наличия заболевания и мутаций в развивающемся эмбрионе. Например, впервые ПЦР была использована таким образом для диагностики серповидно-клеточной анемии путем обнаружения мутации одного гена. Как проводится ПЦР-анализ Метод полимеразно-цепной реакции постоянно развивается. Самым распространенным на сегодня является тест в реальном времени, с помощью которого можно определить исходное количество копий ДНК РНК.
Всё это позволяет назначить максимально подходящее лечение для каждого конкретного случая.
Разновидности анализов ПЦР на выявление гепатита С подразумевает несколько исследований: качественного анализа; генотипирования. Качественный анализ ПЦР ещё называют качественным анализом. Если он показывает отрицательный результат, значит, распознать вирус в организме нельзя, так как его содержание меньше, чем оборудование может уловить. В такой ситуации нужно определиться, насколько реагент чувствителен, чтобы скорректировать дальнейшее решение. Анализ может показать положительный результат уже приблизительно через пять дней после того, как человек заразился. Количественный анализ Этот вид исследования анализа демонстрирует уровень вирусной нагрузки, т.
Этот вид анализа ПЦР назначается больному перед тем, как начать противовирусную терапию, или после трёх месяцев лечения, чтобы посмотреть, насколько эффективен назначенный курс. Этот вид анализа показывает: насколько велика опасность заразить другого человека, эта вероятность прямо пропорциональна показаниям вирусной нагрузки; какое лечение подойдёт в этом случае, и насколько оно будет плодотворным; длительность лечения — чем выше концентрация вирусов, тем дольше будет терапия. Пациенту стоит знать, что тяжесть заболевания может не зависеть от уровня вирусной нагрузки. Иногда даже при высокой концентрации вирусов в крови пациента, печень оказывается поврежденной лишь в незначительной степени. Однако если у беременной женщины высокий уровень вирусной нагрузки, то велика вероятность передать заболевание своему ребёнку. Считается, что нижняя норма концентрации РНК-вируса — до 600.
Генотипирование Из-за того, что этот вирус подвержен высокой мутации, в ходе исследования очень важно определить, какой конкретно генотип находится в крови человека. Всего существуют 11 генотипов гепатита С и множество их подвидов.
COrona VIrus Disease. Опасен развитием двустороннего воспаления лёгких и острой дыхательной недостаточности. Проявления напоминают ОРВИ, но настораживает сухой кашель без отделения мокроты, боли в мышцах, одышка, чувство сдавления в груди.
При острых признаках заболевания исследуют мазки из зева методом ПЦР, который выявляет генетический материал возбудителя РНК и подтверждает диагноз. Что такое антитела к коронавирусу Антитела, или иммуноглобулины — специальные белки, которые вырабатывает иммунная система в ответ на попадание любого инфекционного агента, в том числе CoV-2 в организм человека, даже если не было ярких признаков болезни. Антитела распознают коронавирус, обезвреживают и сохраняют информацию об инфекции на случай новой встречи с инфекцией. Как образуются антитела На первой неделе заболевания начинают синтезироваться иммуноглобулины М IgM. Они первыми встречаются с инфекцией, поэтому считаются маркерами острой первичной инфекции.
Однако, тест на определение антител класса М может давать неспецифическую реакцию, что в ряде случаев приводит к ложноположительному результату. Поскольку на антитела класса М возложена ответственность первыми начать отражать инфекцию и сделать максимально быстро, то эти белки не очень специфичны и могут не очень точно улавливать вирус. К неспецифической реакции с тест- системой могут привести процессы, связанные с воспалением в организме: острые и хронические воспалительные процессы, аутоиммунные заболевания, проблемы с щитовидной железой, беременность и так далее. Это называется "ложноположительный" результат. При стандартном инфекционном заболевании в том числе и при коронавирусной инфекции обычно антитела IgM через месяц исчезают, заменяясь на более специфичные антитела IgG.
Однако учёные выяснили, что при коронавирусе IgM могут сохраняться длительное время до 1,5-3 месяцев от появления симптомов, когда уже сам вирус давно не обнаруживается. Иммуноглобулины А IgA также вырабатываются в острый период инфекции.
Это может быть уретра, влагалище, шейка матки, цервикальный канал, задний проход, ротовая, носовая и даже глазная полость.
Мазки наиболее актуальны при диагностике заболеваний, передающихся половым путём. Для взятия мазка или соскоба используются зонды с разными наконечниками; Кровь из вены берут, когда нужно обнаружить ВИЧ, гепатит, цитомегаловирус, мононуклеоз или какое-либо заболевание бактериальной этиологии, например, сифилис, холеру или боррелиоз; Биологические жидкости моча, слюна, сперма, мокрота, секрет предстательной железы, желудочный сок, плевральная, суставная, спинномозговая или амниотическая жидкость, а также бронхоальвеолярный лаваж берутся по показаниям. Например, ПЦР-анализ мокроты используется при диагностике туберкулёза; Пунктаты и биоптаты органов и тканей, как правило, берутся при подозрении на онкологию.
Исключение составляет биопсия желудка, которую проводят для определения наличия Helicobacter pylori — бактерии, вызывающей гастрит и язвенную болезнь. Хранение и транспортировка биоматериалов Пробы подлежат отправке в амплификатор не позднее, чем через 2 часа после забора, если они находятся в помещении при комнатной температуре. После оттаивания они должны быть сразу использованы, повторное замораживание запрещено.
В подавляющем большинстве случаев ПЦР-диагностика проводится «день в день»: пациент приходит в клинику, где у него берут мазок или кровь и сразу отправляют биоматериал в лабораторию, поэтому беспокоиться о правилах хранения не стоит. Как подготовиться к ПЦР-диагностике? Правила довольно просты: Мазок или соскоб из половых путей, как у мужчин, так и у женщин, сдается после 72-часового воздержания от сексуальных контактов, непосредственно перед забором нужно произвести туалет интимной зоны и 2-3 часа не мочиться.
Прекрасной половине человечества не следует планировать визит в лабораторию во время менструации и сразу после неё, кроме того, запрещено использовать какие-либо средства, нарушающие естественное состояние микрофлоры влагалища спринцевания, свечи. Всем пациентам необходимо завершить антибактериальную терапию если таковая проводилась не позднее, чем за 2 недели до ПЦР-анализа; Кровь сдается из вены утром натощак; Мочу и сперму собирают в маленькие стерильные контейнеры, которые можно приобрести в аптеке, если процедура забора будет производиться дома. Но не забывайте о сроках хранения и транспортировки биоматериалов — максимум 2 часа; Слюну собирают после 3 часов воздержания от приёма пищи и напитков, допустимо только полоскать рот водой.
Непосредственно перед забором рекомендуется помассировать область слюнных желёз. Прочие, редко используемые виды биоматериалов собирают только в клинике, где вам и предоставят все необходимые пояснения относительно подготовки. Результаты ПЦР-анализа Выше мы упоминали о качественной и количественной ПЦР-диагностике, так вот, в первом случае расшифровка результатов не представляет никакой трудности: ответ либо положительный, либо отрицательный.
И если условия подготовки, сбора биоматериала, проведения анализа и оценки итогов не были нарушены, то нет и причин сомневаться в достоверности полученных данных.