За звучной аббревиатурой ПЦР скрывается сложная и не слишком понятная для рядового пациента расшифровка — полимеразная цепная реакция. Можно ли употреблять алкоголь перед сдачей теста ПЦР и как это повлияет на результат? Дайджин-тест более простой в выполнении, чем ПЦР-анализ, и вместе с этим отличается высочайшей надежностью. Полимеразную цепную реакцию (ПЦР, PCR) изобрёл в 1983 году Кэри Мюллис (американский учёный). Что представляет собой анализ методом ПЦР?
ПЦР анализ: что это такое? На какие 12 инфекций сдается?
ПЦР положительный чаще всего фиксируется в период клинических симптомов разгара болезни. В случае носительства возбудителя, а также до трех-шести месяцев после проведения лечения и эрадикации возбудителя. Нередко встречается и ложноположительные результаты ПЦР сразу после лечения. Когда разрушенные участки генетического материала уже погибшего возбудителя еще сохраняются в крови или биологических средах. Результат становится отрицательным по истечении шести-девяти месяцев после терапии. Какой врач проводит расшифровку ПЦР-исследований Первично назначается анализ либо венерологом, либо урологом, либо гинекологом для женщин.
Оценка анализа и выставление результатов в бланке ответа — это функция врача-лаборанта, проводившего исследование. Дальнейшая интерпретация полученных данных — это функционал узкого специалиста, к которому обращается пациент. Врач назначает такие исследования обычно при: признаках острого воспаления урогенитального тракта, для уточнения причины воспаления, перед планируемой беременностью или эко, у беременных с отягощенной акушерской историей, для контроля эффекта от проводимого лечения по поводу вензаболевания не раньше, чем спустя месяц после окончания терапии , в качестве скрининга для исключения бессимптомного течения инфекции при наличии более одного партнера за год. Методы молекулярной биологии имеют важное от культуральных или серологических методик отличие.
При качественном обнаружении РНК вируса гепатита С. При остром и хроническом вирусном гепатите С. При микст-гепатитах. При планировании, во время и после окончания противовирусной терапии. Низкая виремия наиболее благоприятный прогноз течения заболевания и эффективности терапии.
Высокая виремия. Что может влиять на результат? Недостоверный результат может быть получен при: загрязнении биоматериала; наличии в образце ингибиторов — химических и белковых субстанций, влияющих на различные компоненты ПЦР; присутствии в крови гепарина. Важные замечания Уровень вирусной нагрузки крови не указывает на степень повреждения печени и тяжесть заболевания. Для их оценки необходимо исследовать биохимические показатели и материалы биопсии. При планировании лечения очень важно определить генотип вируса гепатита С. Также рекомендуется.
Здесь Вы получаете ответы от реальных практикующих специалистов в своей области.
Оставайтесь с нами и будьте здоровы!
Как узнать, переболел я или нет ведь кашлял же зимой? Являюсь ли безопасным для окружающих? Могу без страха навещать бабушку, маму, друзей? Эти и другие вопросы волнуют многих людей. Прошло достаточно времени чтобы появилась возможность ответить на них. Для оценки возможного иммунитета есть скрининговое исследование на антитела к коронавирусу IgM и IgG. COrona VIrus Disease.
Опасен развитием двустороннего воспаления лёгких и острой дыхательной недостаточности. Проявления напоминают ОРВИ, но настораживает сухой кашель без отделения мокроты, боли в мышцах, одышка, чувство сдавления в груди. При острых признаках заболевания исследуют мазки из зева методом ПЦР, который выявляет генетический материал возбудителя РНК и подтверждает диагноз. Что такое антитела к коронавирусу Антитела, или иммуноглобулины — специальные белки, которые вырабатывает иммунная система в ответ на попадание любого инфекционного агента, в том числе CoV-2 в организм человека, даже если не было ярких признаков болезни. Антитела распознают коронавирус, обезвреживают и сохраняют информацию об инфекции на случай новой встречи с инфекцией. Как образуются антитела На первой неделе заболевания начинают синтезироваться иммуноглобулины М IgM. Они первыми встречаются с инфекцией, поэтому считаются маркерами острой первичной инфекции. Однако, тест на определение антител класса М может давать неспецифическую реакцию, что в ряде случаев приводит к ложноположительному результату.
Анализ ПЦР 12 инфекций
Так, результат лечения альфа-интерфероном оценивают через 24 недели по окончании курса по наличию или отсутствию РНК HCV в крови. В результатах исследования указывается, есть ли вирус в организме или нет при отсутствии инфицирования или при выздоровлении. Пройдите онлайн-тест, чтобы узнать есть ли у вас аллергия Количественный анализ: когда он нужен? Количественный анализ — способ определения вирусной нагрузки на организм. Он также может быть проведен двумя методами: определением количества частиц вируса в крови или методом ПЦР.
Его цена примерно в два раза выше, чем у качественного анализа на такое же количество штаммов в среднем 2200 против 1200 не считая стоимости забора материала. Дайджин-тест более простой в выполнении, чем ПЦР-анализ, и вместе с этим отличается высочайшей надежностью. Поэтому многие развитые страны включают в скрининговое исследование именно его.
Тест может быть комплексным — для группы низкого и повышенного риска, или проводиться отдельно для каждой группы. Оценивается только присутствие вирусов в клинически значимой концентрации, то есть одновременно оценивается и вирусная нагрузка. В группе высокоонкогенных вирусов проверяется наличие 13 типов: 16, 18, 31, 33, 39, 35, 45, 51, 52, 56, 59, 58, 68 штаммов. В группе вирусов с низким риском — 6, 11, 42, 44, 43. Полученные результаты не дифференцируются по штаммам. Ошибки при нахождении штамма практически исключены. Концентрация обозначается в других единицах, нежели в анализе ПЦР — не в геном-эквивалентах, а в относительных единицах они отражают отношение количества копий вируса к значению, которое считается пороговым.
Положительным считается результат, превышающий 1 относительную единицу. В отличие от ПЦР-анализа, ответы Digene-теста клиники готовят в течение 10 дней. Если получен результат ниже количественно значимого порога, будет выдан ответ «не обнаружено». Поэтому результаты дайджен-теста и качественного ПЦР-анализа, в котором даже минимальное количество вируса считается положительным результатом, могут быть противоположными. Врачи рекомендуют проходить digene-тест, поскольку при прочих равных он выгоднее в финансовом плане — после получения результатов не придется отдельно проводить количественный анализ. Подготовка к анализам Как уже говорилось, и в ПЦР-анализе, и в дайджин-тесте используется генетический материал. Для его получения необходимо выполнить забор клеток эпителия из урогенитального тракта.
Обычно у женщин берут соскоб из цервикального канала, у мужчин — из уретры. Иногда используется материал из прямой кишки, полости рта — при наличии там новообразований. В отличие от многих других ПЦР-анализов, при исследовании ВПЧ не используют кровь, поскольку вирус в ней практически не обнаруживается. Рекомендации для женщин: Чтобы получить достоверные результаты, женщине рекомендуют сдавать анализ не раньше чем через 5 дней после начала менструального цикла и не позже чем за пять дней до его окончания. Первым днем цикла считается первый день менструации. Оптимальное время сдачи анализа — первая половина цикла; За сутки до проведения исследования и в тот же день исключаются интимные контакты, спринцевания, использование интравагинальных лекарственных и контрацептивных средств; УЗИ органов малого таза с использованием интравагинального датчика, кольпоскопию и соскоб разносят во времени на 3-4 дня. Рекомендации для мужчин: не мочиться за 2-3 часа до соскоба из уретры; отказаться от интимных контактов за 2 суток; общие рекомендации: закончить прием антибиотиков перорально или в виде инъекций за месяц до обследования; прекратить лечение с помощью местных антибактериальных или антисептических средств за 2 недели до обследования; в день обследования не мыть половые органы с использованием антибактериального мыла или геля.
Все это относится к плановой сдаче анализов, но если при обращении к врачу обнаружены патологические изменения, соскоб берут сразу же, без подготовки. Процедура забора материала У женщин клетки эпителия берут на гинекологическом кресле с помощью одноразовой цитологической щеточки, которую вводят в цервикальный канал на 1-1,5 см, несколько раз прокручивают вокруг оси, затем аккуратно вынимают так, чтобы не загрязнить материал вагинальными выделениями. Это безболезненная и быстрая процедура. Мужчине в уретру вводят специальный зонд, всего на 3-4 см, так что болевых ощущений тоже не будет. Затем зонд или щеточку опускают в пробирку с жидкостью, прополаскивают, отжимают о стенки, вынимают. Пробирку закупоривают и отправляют в лабораторию. Стоимость забора материала в клиниках в среднем составляет 400 руб.
Эту сумму прибавляют к сумме за само исследование. Сроки проведения анализов Первично анализ на ВПЧ рекомендуется сдать в следующих ситуациях: при плановом гинекологическом осмотре женщины старше 30 лет если результата будет отрицательным, анализ рекомендуется сдавать каждые три года ; при получении сомнительного цитологического мазка ПАП-теста ; после обнаружения на осмотре остроконечных кондилом, диспластических изменений шейки матки. Если у женщины старше 30 лет анализ на онкогенный штамм ВПЧ положительный, это может означать, что инфекция персистирует, и иммунитет не может уничтожить возбудителя. До этого возраста опасность невелика — обычно повторные анализы оказываются «чистыми».
Но для каждого микроорганизма реактив нужен свой, так что универсальных тестов ПЦР на все инфекции сразу не бывает. Подготовка к анализу зависит от того, какой биологический материал вы сдаете. Если кровь, то особо готовиться не надо. Для других материалов есть несложные правила — если их соблюдать, анализ будет точнее.
Если вам назначили качественный ПЦР-анализ, имеет смысл сдавать его или в государственной лаборатории если обследование положено по ОМС , или в частной, где окажутся подходящие цены.
Здесь Вы получаете ответы от реальных практикующих специалистов в своей области. Оставайтесь с нами и будьте здоровы!
В Минздраве объяснили, от чего зависит результат ПЦР-теста
Аббревиатура ПЦР обозначает полимеразная цепная реакция. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – наиболее информативный, точный и современный метод диагностики инфекционных заболеваний, позволяющий обнаружить возбудителя в организме пациента, даже если количество вредоносных клеток исчисляется единицами. Специфичность большинства тестов ОТ-ПЦР составляет 100%, поскольку конструкция праймера специфична для геномной последовательности SARS-CoV-2. Основы полимеразной цепной реакции (ПЦР). Отличие иммуноферментного анализа (ИФА) от полимеразной цепной реакции (ПЦР) в том, что ПЦР относится к прямым методам выявления возбудителя инфекции, то есть позволяет определить РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале человека.
HCV, РНК количественно [реал-тайм ПЦР]
ПЦР или полимеразная цепная реакция является золотым стандартом в диагностике многих инфекций. Разобравшись, чем отличается тест ПЦР от антител на КОВИД, удастся облегчить диагностику коронавирусной инфекции, избежать лишних финансовых трат на несвоевременные или недостоверные обследования. Маркеры гепатита С. Анализы методом ПЦР и ИФА для выявления в крови вируса гепатита С. ПЦР или полимеразная цепная реакция — на сегодняшний день самый точный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет узнать, присутствует ли в вашем организме вирус COVID-19. Тест на коронавирус, проводимый через полимеразную цепную реакцию, позволяет определить, болеет обследуемый или нет. Метод ПЦР позволяет идентифицировать в биологическом материале искомый участок генетического материала и обнаружить единичные молекулы ДНК микроорганизмов, не выявляемые другими методами.
Антитела к вирусу гепатита С
В определении количественной ПЦР ключевым достижением стало создание флуоресцентных ДНК-зондов, добавляющихся в реакционную смесь одновременно с простыми праймерами и позволяют отслеживать во времени процесс ПЦР, то есть real-time-ПЦР. Под методологией TaqMan понимается синтез флуоресцентных ДНК-зондов, которые специфичны к средней части ампликона и имеют две метки на концах. Одной из них является флуоресцентная метка, вторая — молекула-гаситель данной флуоресценции. Особый прибор, представляющий собой гибрид флуориметра и термоблока-амплификатора, производит постоянные замеры в каждой пробирке флуоресценции принцип real-time-ПЦР.
После 20-40 циклов ПЦР в результате для каждого образца будут получены индивидуальные кривые. Количество копий искомого гена, который содержится в исследуемом образце, может быть вычислено по калибровочным кривым с контрольными образцами. Также важной особенностью осуществления ПЦР флуоресцентным методом является то, что пробирки со смесью ПЦР нет необходимости открывать при учете результатов.
За счет этого снижается возможность заражения продуктами амплификации помещений, и необходимость в выделении особых рабочих областей для проведения электрофореза отпадает. Что показывает расшифровка количественной ПЦР? Что обнаруживается?
Посредством такого метода, как количественная ПЦР, находят качественные изменения в генах: вставки, делеции и точковые мутации. Но при некоторых наследственных нарушениях соответствующие симптомы появляются в ответ на изменение содержания определенных генов. Это значит, что в одном миллилитре исследуемого образца найдено определенное количество копий РНК или ДНК возбудителя, измеряемое в международных единицах.
В зависимости от величины диагностируется тяжесть инфекции. Для установления вирусной нагрузки обычно исследуют кровь, поскольку вирусы при заболевании свободно двигаются в крови. Особенности Количественная ПЦР в анализе крови обладает двумя особенностями.
Анализ проводится в присутствии праймеров или дезоксирибонуклеозидтрифосфатов, которые мечены посредством флуоресцентной или радиоактивной метки для точного определения содержания сформировавшегося продукта ПЦР. Связано это с тем, что на конечной стадии насыщения, когда становится очень много продуктов ПЦР, лимитирующими звеньями данной реакции выступают как сам фермент, так и субстраты. Окончание очередного цикла ПЦР в таких условиях уже не характеризуется удвоением количества продуктов ПЦР, нивелируются незначительные количественные отличия между различными пробами, довольно четко определяемыми на ранних этапах после прохождения ряда циклов реакции.
Стоимость ПЦР-диагностики ПЦР-исследование имеет стоимость, которая зависит от того, какая именно инфекция будет проверена, от методики анализа и исследуемого материала. Чтобы определить одну инфекцию, придется отдать в пределах 200-800 рублей. Также добавляется плата за взятие биоматериала — примерно 400 рублей.
Результаты ПЦР диагностики Методика обладает сто процентной специфичностью, то есть в ходе анализа определяется именно запланированный возбудитель. В отличие от микроскопии мазков при данном исследовании нельзя принять один вид возбудителя за другой. Или спутать его с внешне похожими клетками, например, измененным эндотелием.
Даже обломки нуклеиновых кислот, остающиеся после инфекционного агента по окончании терапии специфическими антибактериальными препаратами, будут давать положительные результаты анализов ПЦР. Для получения максимально достоверных результатов важен правильный забор биологического материала. Он должен исключать загрязнение инородными инфекционными агентами.
ПЦР положительный чаще всего фиксируется в период клинических симптомов разгара болезни. В случае носительства возбудителя, а также до трех-шести месяцев после проведения лечения и эрадикации возбудителя. Нередко встречается и ложноположительные результаты ПЦР сразу после лечения.
Чтобы считаться здоровым, после самоизоляции человек должен дважды сдать отрицательный тест на COVID. И у него не должно быть респираторных симптомов. IgM равен или больше 2 и IgG равен или больше 10 Вероятно, болезнь уже посетила обладателя этих показателей и отступает. Для профилактики пациента отправят на 7-дневную изоляцию. Затем нужно будет снова сделать тест. Если за неделю состояние ухудшится, то обязательно нужно вызвать врача.
IgM меньше 2 и IgG равен или больше 10 Хорошие новости. Такой результат говорит о том, что человек уже переболел и у него выработались антитела. Несмотря на приобретенный иммунитет, переболевший все еще может быть опасен для окружающих.
В ходе исследования копируется только тот участок, который подходит под заданные условия, и только в ситуации присутствия его в исследуемой пробе. Например, материал для исследования, в котором предполагается наличие фрагментов ДНК или РНК возбудителя слюна, кровь, моча, выделения из половых органов , помещается в специальный реактор амплификатор. Далее к нему добавляются специфические ферменты, которые связываются с ДНК или РНК патогена, и происходит синтез ее копии. Это копирование идет в несколько этапов по типу «цепной реакции», и в конечном итоге из одной копии генетического материала могут образоваться сотни и тысячи копий. Затем идет анализ и сравнение результата с имеющейся базой данных о строении различных возбудителей. Посредством ПЦР можно не только выявить тип возбудителя, но и выдать количественный результат анализа, то есть как много возбудителей в организме человека. Метод ПЦР в настоящее время расширяет круг возможностей проводимых исследований: введение мутаций, сращивание фрагментов ДНК, и получил широкое распространение в медицине, к примеру, для установления отцовства, появление новых генов и прочее. Материал для исследования и правила его забора Материалом для ПЦР-исследования, в котором можно выявить чужеродную ДНК бактерии или ДНК или РНК вируса могут служить различные биологические среды и жидкости человека: слизи, моче, крови, мокроте, соскобе эпителиальных клеток, тканях плаценты, крови, соке простаты, околоплодные воды, плевральная жидкость. При обследовании на инфекции, передающиеся половым путем ИППП , у мужчин и женщин забираются выделения из половых органов, мазок или соскоб из шейки матки, мазок или соскоб из уретры мочеиспускательного канала , моча. Нередко для обследования на поражение нервной системы при ряде исследований забирается спинномозговая жидкость. В пульмонологии материалом служит мокрота, плевральная жидкость. При обследовании на внутриутробные инфекции — околоплодные воды, ткани плаценты. Подготовка к сдаче материала и проведению ПЦР-диагностики Практически все пациенты, которым проводится ПЦР-диагностика, вправе рассчитывать на достоверный, точный и быстрый результат, зависящий в большой степени от возможности лаборатории, профессионализма врача-лаборанта.
Если сахар и фосфат одинаковы у всех нуклеотидов в ДНК в РНК сахар другой , то азотистых оснований четыре если не считать редкие модификации : аденин, тимин, цитозин и гуанин, обозначаемые А, Т, Ц и Г соответственно. В молекулах РНК тимин заменен урацилом. Нуклеотиды соединяются в цепочку, образуя связи между фосфатной группой одного нуклеотида и гидроксильной — другого. Чтобы молекула была стабильной, цепочки должны как-то взаимодействовать друг с другом. Это обеспечивают водородные связи , образующиеся между азотистыми основаниями противоположных цепей по принципу комплементарности : А соединяется только с Т или У в РНК , а Г — с Ц рис. И поэтому, имея одну цепь ДНК, в соответствии с этим правилом легко построить ее пару. Собственно, на этом и основана ПЦР. Рисунок 5. Строение ДНК. Видео 2. Типичная реакционная смесь Анализируемая ДНК. Это может быть как отдельный кусочек молекулы, так и плазмида, хромосома или геном клетки полностью. Для грубой оценки сойдет даже суспензия клеток. ДНК служит матрицей для многократного копирования нужного участка. Праймер — это искусственно синтезированная короткая цепочка нуклеотидов 15—30 штук , комплементарная выбранному участку одной из цепей анализируемой ДНК. Один из праймеров обычно соответствует началу амплифицируемого отрезка, другой — его концу, но на противоположной цепи. Фермент, строящий комплементарную матричной цепь ДНК. Обычно используют термостабильные полимеразы, изначально выделенные из термофильных бактерий и архей: Thermus aquaticus Taq-полимераза , Pyrococcus furiosus Pfu-полимераза и Pyrococcus woesei Pwo-полимераза. Первая — самая производительная, а две другие — более точные. Раствор, содержащий различные ионы для поддержания нужного рН, соли магния, необходимые для работы полимеразы, и неионный детергент Tween-20 в сочетании с BSA бычьим сывороточным альбумином для предотвращения налипания компонентов реакции на стенки пробирки. В случае ГЦ-богатых матриц в смесь часто добавляют энхансер — ДМСО диметилсульфоксид , предотвращающий нежелательные взаимодействия между комплементарными участками матрицы. Рисунок 6. Состав смеси для ПЦР. Соблюдение правильного соотношения — большая проблема для лабораторий, где в сутки проводят несколько тысяч ПЦР: достаточно незначительно изменить концентрацию солей магния, и результаты ПЦР будут далеки от идеала. ПЦР в режиме реального времени рекомендуется для мультиплексной ПЦР и генотипирования с применением олигонуклеотидных зондов. Материал предоставлен партнёром — компанией «Диаэм» Все компоненты смешивают в нужном объеме деионизованной воды в специальных пробирках для ПЦР и помещают в амплификатор или ПЦР-циклер рис. Рисунок 7. Расходные материалы и оборудование для ПЦР. Видео 3. Приготовление смеси для ПЦР. Этапы реакции Цель ПЦР — получить множество одинаковых двухцепочечных кусочков ДНК строго определенной длины обычно не более 2—3 тысяч пар нуклеотидов, т. Для этого проводят 20—30 циклов реакции. Каждый цикл состоит из трех этапов. Денатурация Чтобы полимераза могла работать, две цепи ДНК-матрицы нужно разъединить.
Почему "ошибаются" ПЦР-тесты - эксперт
Маркеры гепатита С. Анализы методом ПЦР и ИФА для выявления в крови вируса гепатита С. Расшифровка результатов количественного анализа ПЦР играет важную роль в обнаружении и проверке эффективности лечения большого числа хронических заболеваний, скажем гепатита C. Анализ ПЦР на HCV, виды: отрицательный, положительный и расшифровка. Полимеразная цепная реакция почти для каждого из нас стала обыденностью, даже если этот каждый никогда и слов таких не слышал. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — метод молекулярной биологии. Как расшифровать ПЦР Как работает ПЦР тест Ответы на эти и другие вопросы читайте в статье на нашем сайте.
12 методов в картинках: полимеразная цепная реакция
это определение вируса в мазке из ротоглотки методом ПЦР. Статья автора «РИА Новости» в Дзене: ПЦР-тест — основной метод обнаружения коронавирусной инфекции. Тест проводится методом полимеразной цепной реакции качественно и количественно. по Менеджменту антикоагулянтной терапии, утвержденное Министерством Здравоохранения РМ, рекомендует для оценки рисков венозных тромбоэмболий использовать тесты на Д-Димеры со специфичностью не менее 75. Роспотребнадзор напоминает о ключевых особенностях тестирования методом ПЦР и отвечает на самые часто задаваемые вопросы. Статья автора «РИА Новости» в Дзене: ПЦР-тест — основной метод обнаружения коронавирусной инфекции.