ПЦР (полимеразная цепная реакция): что это, показания к анализу, виды тестов и методы диагностики, преимущества и недостатки.
Может ли ПЦР-тест на COVID-19 показать положительный результат при простуде
Если его результат положительный, то этот результат верный. Зависит от того, как взят мазок, сколько он хранился», — пояснил Жемчугов. Иммунолог также уточнил, что на сегодняшний день среди зараженных коронавирусом в шесть раз больше тех, кто болеет бессимптомно и не проходит исследований на наличие COVID-19 — речь идет о так называемой латентной форме вируса. У таких людей могут быть отрицательные результаты тестов на наличие коронавируса, однако потом появляются антитела. Жемчугов выразил уверенность, что их также надо учитывать в составе иммунной прослойки.
Это мешает транспортировке кислорода клетками крови и именно гипоксия недостаток кислорода негативно влияет на лёгкие. Влияние вируса на кровь подталкивает к мысли, что именно в ней мы можем найти SARS-Cov-2 в тяжёлых клинических случаях, хотя не обнаруживаем его на слизистых верхних дыхательных путей. Мы должны научиться выделять вирус из крови. Описана даже кишечная форма короноавируса, проявившаяся тошнотой, рвотой, диареей. И искать его тогда следует в кишечнике, диарейных массах и анальных мазках. Это, кстати, дополнительный фактор, свидетельствующий о том, что вирус передаётся не только воздушно-капельным путём, но и фекально-оральным.
Диагностика по антителам Если ПЦР- это прямой метод обнаружения вируса, то выявление в крови антител к нему — это косвенное свидетельство контакта человека с инфекционным агентом. Иммунная система в ответ попадание патогена в организм вырабатывает защитные антитела. Антитела класса IgM Это первая линия защиты — самый скорый ответ организма. IgM появляются через 3-7 дней с момента инфицирования. А IgG появляется не ранее, чем через 2 недели. Отсутствие антител к коронавирусу у человека, имевшего контакт с больным, не гарантирует, что он не инфицирован — могло пройти слишком мало времени для выработки антител. Поэтому необходимо повторное исследование через неделю.
Сферы применения метода в клинической медицине В клинической медицине ПЦР-диагностика является одним из наиболее востребованных методов анализа в самых разных сферах: Урогинекология.
Для инфекционных заболеваний такого рода характерны слабая выраженность симптомов и хроническое течение, нередко вызывающие бесплодие и невынашивание беременности у женщин. С помощью ПЦР можно выявить наличие целого «букета» половых инфекций: хламидиоза, нескольких видов микоплазмы, уреаплазмы, трихомониаза, гарднереллы, кандиды, гонококка, трепонемы. Кроме этого, ПЦР-диагностике поддается и группа вирусов, поражающих урогенитальный тракт у обоих полов, в особенности, вирус герпеса и вирус папилломы человека. Их своевременное выявление и лечение помогает избежать риска злокачественных заболеваний шейки матки у женщин. Существует множество микроорганизмов, способных поражать плод еще в утробе матери. ПЦР-диагностика позволяет эффективно выявлять наличие неонатальных инфекций как на внутриутробном этапе, так и у новорожденных. К опасным инфекциям относятся цитомегаловирус, токсоплазмы, вирусы краснухи и герпеса, хламидии, микоплазмы. Служба крови.
Чтобы избежать риска переливания, пациентам инфицированной опасными заболеваниями крови или плазмы ВИЧ, сифилис, гепатиты также используется метод ПЦР. Он значительно превосходит по точности серологические методы, поскольку способен выделить даже те инфекции, которые имеют длительный инкубационный период и не определяются при помощи обычных исследований в течение первых нескольких недель. Клиника инфекционных заболеваний. К ним относятся вирус гепатита, СПИД, сальмонеллез, хеликобактериоз, холера, бруцеллез, туляремия, дифтерия, токсоплазмоз и другие инфекции. Фтизиатрия и пульмонология. ПЦР-диагностика позволяет выявить возбудителей атипичных пневмоний и рецидивирующих хронических бронхитов, которыми являются хламидии и микоплазмы. Кроме того, с ее помощью можно не только поставить диагноз, но и провести видовую идентификацию возбудителя, то есть выявить конкретный штамм. Метод ПЦР используется также для ранней и высокоточной диагностики туберкулеза.
На заметку ПЦР-диагностика используется в криминалистике для определения принадлежности найденного на месте преступления биоматериала, а также в экспериментальной медицине, создании генетических паспортов, мониторинге состояния окружающей среды, анализе продуктов питания, фармакологии, ветеринарии. Преимущества ПЦР-диагностики Хотя ПЦР-диагностика и является относительно «молодым» методом, широкое распространение в медицинской практике она получила благодаря явным преимуществам перед другими способами анализа: Прямое определение возбудителя инфекции. Некоторые традиционные методы, такие как иммуноферментный анализ ИФА , выделяют только белки-маркеры, которые являются продуктом жизнедеятельности возбудителей инфекции, а потому только косвенно указывают на присутствие микроорганизмов. Наличие специфического участка в ДНК, выявленное с помощью ПЦР, безошибочно или почти безошибочно указывает на присутствие конкретной инфекции. Высокая специфичность метода. Она обусловлена тем, что в исследуемом материале выявляется фрагмент ДНК, характерный только для конкретного возбудителя инфекции. Специфичность исключает возможность ложных результатов анализа, тогда как в иммунологических методах исследований ошибки вполне вероятны из-за перекрестной реакции антигенов. Высокая чувствительность.
При помощи ПЦР-диагностики можно выявить присутствие в организме даже единичных клеток вирусов или бактерий в тех случаях, когда обычными методами сделать это практически невозможно. ПРЦ определяет наличие всего 10—100 клеток в пробе, тогда как иммунологическими и микроскопическими тестами можно определить наличие инфекции при количестве клеток не менее 103—105.
В вирусах, кстати, тоже, хоть они и не имеют клеточного строения. На этой молекуле аки на дискете закодированы все белки, которые клетка способна производить, а также еще много чего, регулирующего работу клетки. Но если компы используют двоичный код, представляя информацию в виде кучи 0 и 1, то в ДНК информация закодирована последовательностью 4 букв - нуклеотидов. Эти 4 буквы - A, T, G и С - обозначают химические вещества аденин, гуанин, цитозин и тимин. Эти вещества тупо стоят длинной цепочкой, крепко сшитые химическими связями. Прикол в том, что ДНК состоит из двух таких цепочек, причем вторая является зеркальной копией первой это называется умным термином "обратная комплементарность". Как так вышло?
Дело в том, что помимо сильных связей с соседями по цепи, нуклеотиды умеют образовывать еще и относительно слабые водородные связи, причем А и Т всегда будут иметь две связи, а G и С - три. Таким образом, напротив А в одной цепи всегда будет стоять Т в другой, и та же фигня с G и С. Легко понять, что такие цепи, по сути, несут одну и ту же информацию. А так как двойная спираль ДНК значительно более устойчива к воздействию извне, то в ходе эволюции на заре истории Земли цепи решили подружиться и жить вместе. Тем более, что такая дружба дала им одно очень важное преимущество. Репликация ДНК. Рано или поздно клетке надо будет поделиться, обеспечив рост организма или размножение. При этом всю эту хитро упакованную многометровую махину ДНК надо аккуратно скопипастить так, чтобы две дочерние клетки получили максимально точную копию оригинала. Вот тут-то и пригодилась двойная спираль - специальные белки в нужный момент расцепляют цепи, и на основании каждой цепи достраивается ее комплементарная копия.
Отвечает за это фермент под названием полимераза. Она ползет по старой одиночной цепи ДНК и вставляет в новую цепь буквы, комплементарные старой. Видит А - вставляет Т, видит G - C, ну вы поняли. Чтобы полимераза могла сесть на одиночную цепь ДНК и начать свое дело, ей нужна затравка - это уже готовый маленький кусочек второй цепи, сидящий на первой.
Анализ ПЦР 12 инфекций
Суть полимеразной реакции. В зависимости от причины проведения ПЦР-теста положительный результат может указывать на наличие исследуемого возбудителя. Отрицательный результат будет говорить об отсутствии возбудителя в организме. Положительный результат ПЦР теста означает, что пациент в настоящее время инфицирован определенным патогеном. Ученые из Италии проверили, может ли появиться жизнеспособный вирус в дыхательных путях людей, выздоровевших от COVID-19 и потом снова получивших положительный результат ПЦР-теста. У подавляющего большинства таких пациентов, скорее всего, нет вируса. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — это метод молекулярно-генетической диагностики, позволяющий обнаружить в организме человека различные инфекционные заболевания.
Сколько стоит сдать ПЦР-анализ
Запомнить ПЦР-тесты помогают обнаружить фрагменты генетического материала бактерий, вирусов или других людей. Но для каждого микроорганизма реактив нужен свой, так что универсальных тестов ПЦР на все инфекции сразу не бывает. Подготовка к анализу зависит от того, какой биологический материал вы сдаете. Если кровь, то особо готовиться не надо. Для других материалов есть несложные правила — если их соблюдать, анализ будет точнее.
Это высокотехнологичная лаборатория, располагающая арсеналом высокочувствительных и высокоспецифичных реагентов, поэтому особых недостатков она не имеет. Разве что выдает положительный результат при отсутствии клинических проявлений и тем самым ставит лечебника перед дилеммой: стоит начинать лечение или нет? Врач, наблюдающий пациента, начинает сомневаться в достоверности результатов тестирования, поскольку никаких признаков заболевания не видит. Но все же, учитывая высокую чувствительность ПЦР-системы, следует помнить, что она обнаруживает возбудителя даже в доклинической стадии, а положительный результат в таком случае является скорее достоинством, чем недостатком. Исходя из этого, лечащий врач должен сам принять решение о целесообразности терапии, взяв во внимание и другие аргументы «за» и «против».
Например, при диагностике хламидийной инфекции, где ПЦР относится к основным методам, наряду с хламидией, можно обнаружить и нейссерию гонококк — возбудитель гонореи. Причем, на достоверности результатов это негативно не отражается; Тестирование методом ПЦР выявляет опасные микроорганизмы в инкубационном периоде, когда они еще не успели нанести ощутимый вред организму, то есть, ранняя диагностика предупреждает о грядущем развитии патологического процесса, что дает возможность подготовиться к нему и принять во всеоружии. Кроме этого, во избежание недоразумений, иной раз возникающих при диагностике, ПЦР защищает себя еще и тем, что ее результаты могут зафиксироваться фотография, компьютер с целью использования их в экспертных целях, если будет на то необходимость. Нормой в ответах ПЦР считают отрицательный результат, указывающий на отсутствие фрагментов чужеродных нуклеиновых кислот, положительный ответ будет свидетельствовать о наличии инфекции в организме, цифровые значения означают состояние вируса и его концентрацию на момент тестирования. Однако полную расшифровку анализа осуществляет врач, прошедший специальную учебу по теме «ПЦР». Пытаться же интерпретировать результаты самостоятельно не имеет никакого смысла, поскольку можно, что скорее всего и произойдет, неправильно понять и начать заранее волноваться. Чего «боится» ПЦР, что она умеет и как к ней подготовиться?
Чтобы обнаружить скрытое присутствие вируса герпеса в крови, необходимо сдать анализ на антитела IgG. Противопоказания Соскоб ПЦР не берут во время месячных. Альтернативой может стать анализ крови.
Также исследование не проводят во время местной или общей антибактериальной терапии. Подготовка к ПЦР При взятии крови достаточно не употреблять утром пищу. Исследование проводится натощак. Анализ ПЦР урогенитального мазка предполагает соблюдение следующих рекомендаций: в течение 2-3 дней воздержаться от половой жизни, не спринцеваться, не пользоваться вагинальными препаратами и тампонами, средствами для интимной гигиены с антисептическим действием; после трансвагинального УЗИ, кольпоскопии или биопсии должно пройти не менее 2 дней; в день исследования подмыться теплой водой без применения моющих средств. Соскоб из уретры у мужчин берут не ранее, чем через 2 часа после последнего мочеиспускания. Женщинам анализ следует делать до менструации или через 2-3 дня после ее окончания. Несоблюдение правил подготовки и прием антибиотиков влияют на достоверность исследования. Как сдать ПЦР 12?
Тест ИФА на наличие антител позволяет определить наличие специфического материала, формирующегося в результате перенесенного заболевания. Наличие определенного количества антител свидетельствует о том, что человек перенес коронавирус.
Чем больше титр антител в крови, тем выше иммунитет человека и устойчивость к действию патогенных вирусов. Тестирование на антитела наиболее важно для медицинских работников, пребывающих в инфекционных отделениях, а также для категорий населения, которые в силу своей профессиональной деятельности проводят много времени в контактах с другими людьми. ПЦР помогает установить наличие вируса в мазке из ротоглотки или носоглотки. ИФА-тест показывает реакцию иммунной системы на вторжение инфекции. Он также, как и ПЦР-тест, показывает наличие вируса, но относится к менее достоверным и точным методам диагностики. Отличие есть также в стоимости тестов. ИФА-тестирование намного доступнее. Показания к проведению ПЦР-диагностики появление у пациента признаков, типичных для коронавирусной инфекции; воспаление легких как возможное осложнение инфекции; работа медицинских работников в отделениях, где лечат больных с коронавирусной инфекцией; деятельность патологоанатомом или работа в судебно-медицинском бюро; в период подготовки к проведению хирургической операции. Эти лица входят в перечень лиц, подлежащих обязательному тестированию. Все желающие, которые не входят в эту группу, могут сделать ПЦР-тест по своему желанию в медицинских центрах и клиниках.
ПЦР-тест требуют при въезде в большинство стран как подтверждение отсутствия инфицирования.
ПЦР-исследования
ПЦР — это полимеразная цепная реакция. ПЦР — это полимеразная цепная реакция. Положительный результат ПЦР-тестирования позволяет своевременно выявить заболевание, назначить нужное лечение и добиться изоляции пациента, что сохранит других людей от риска заражения. положительный, IgM – положительный. Вы находитесь на поздней стадии заболевания или выздоровления. Ученые из Италии проверили, может ли появиться жизнеспособный вирус в дыхательных путях людей, выздоровевших от COVID-19 и потом снова получивших положительный результат ПЦР-теста. У подавляющего большинства таких пациентов, скорее всего, нет вируса.
Что такое ПЦР-тест и для чего его сдают
- Что такое положительный анализ ПЦР? Что означает, если анализ ПЦР положительный?
- Содержание
- Что это такое
- Что такое ПЦР анализ на коронавирус и что он показывает?
- Как определить коронавирус или что такое метод полимеразной цепной реакции (ПЦР)?
- Что такое ПЦР: достоверность и точность | «Бест Клиник»
ПЦР ДИАГНОСТИКА. Что это такое?
Если его результат положительный, то этот результат верный. «Если экспресс-тест показал положительный результат, а ПЦР-тест — отрицательный, такое может быть, потому что вирусы не сидят и не ждут. Таким образом, при простуде ПЦР-тест не может дать положительный результат на коронавирус. ПЦР-тестирование рекомендовано для диагностирования COVID-19 ВОЗ и Центром по контролю и профилактике заболеваний США. ПЦР или, иначе, полимеразная цепная реакция – это современный высокоинформативный метод молекулярно-генетической диагностики, активно применяемый для выявления у человека различных инфекционных и наследственных заболеваний. анализ ПЦР положительный Положительный анализ ПЦР (полимеразной цепной реакции) обозначает, что в изученном материале была обнаружена инфекция, которую искали. medium ПЦР (Полимеразная цепная реакция) Если попытаться описать ПЦР-диагностику в трёх словах, то это, совершенно определённо, будут слова ТОЧНО, НАДЁЖНО, БЫСТРО. В свою очередь главврач клинико-диагностической лаборатории "Инвитро — Сибирь" Андрей Поздняков считает, что надолго сохраняющийся положительный ПЦР-тест может быть связан с особенностями дельта-варианта коронавируса.
Сколько можно болеть: почему даже спустя месяц ПЦР-тест на ковид остается положительным
При 40-60 градусах в зависимости от ряда факторов маленькие затравки находят комплементарный участок на одиночной цепи и садятся на него. При 72 градусах полимераза садится на затравку и начинает достраивать новую цепь, пользуясь старой как шаблоном. Откуда именно 72 градуса - очень интересная история о пользе фундаментальной науки, как-нибудь в другой раз. В результате такого цикла из одной двойной спирали получаются две! Как несложно догадаться, теперь надо все это повторить еще раз, чтобы из 2 сделать 4, потом 8... Ну, вы поняли - это цепная реакция!
Тем не менее, этого хватает, чтобы получить рабочие концентрации ДНК, с которыми можно уже делать серьезное дело. Аппаратная база. Бедняга Муллис и его последователи сначала использовали тупо три водяных бани с разной температурой, вручную перемещая из одной в другую ценные пробирки с реакцией. Мы на практике в универе почему-то делали так же... Но как только мир понял, что ПЦР - это офигенно, сразу появились лабораторные приборы, которые этот процесс автоматизируют.
Фактически это просто нагревательный блок, способный очень точно держать температуру в течение заданного времени и быстро его менять. Сейчас их на рынке пруд пруди, на любой вкус и цвет, чуть ли не кофе умеют готовить. Но как нам это все помогает при анализах на вирус? Вот такой милаха прогонит ПЦР за полчасика Медицинское применение. Причем ее может быть изначально очень мало, но цепной характер реакции позволит нам ее приумножить.
Но если изначально целевой ДНК в пробе нет, то и реакция не пройдет. Добавляем полимеразу и праймеры, которые сядут именно и только на определенное место в ДНК какого-то интересующего нас патогена ДНК патогена ведь сильно отличается от нашей. Запускаем реакцию и смотрим, прошла она или нет! Если прошла - значит, пациент был заражен этим патогеном, а на нет и суда нет.
За счёт близости гасителя, энергия поглощаемая флуорофором не вызывает флуоресцентного свечения, а целиком передаётся гасителю. При этом, при облучении смеси ультрафиолетом, флуоресцентный отклик полностью отсутствует. Дальше всё происходит, так же, как было описано выше: В ходе ПЦР при повышении температуры происходит денатурация ДНК с распадом на две половинки. Зонд вместе с праймерами присоединяется к комплементарному участку ДНК. При этом флуорофор и гаситель освобождаются, расстояние между ними увеличивается и эффект гашения перестаёт работать.
Теперь при облучении смеси ультрафиолетом, мы получим устойчивый флуоресцентный сигнал-отклик от флуорофора. Изготавливая молекулы флуорофора с разным цветом свечения можно проводить одновременный поиск разных возбудителей в одной пробирке. Большинство используемых сегодня, для ПЦР диагностики, амплификаторов , относится к классу автоматических, высокоскоростных многофункциональных Real Time аппаратов. Они позволяют проводить множественный ПЦР анализ до 5 мишеней цветных флуоресцентных красителей в 96 пробирках одновременно. Это полностью автоматические термоциклеры со встроенным оптическим блоком и возможностью детекции накопления продуктов амплификации непосредственно в пробирке во время протекания реакции. Весь процесс амплификации протекает в закрытых одноразовых пробирках, считывание происходит через прозрачные стенки пробирок, без их открытия. Но они напрямую связаны с его достоинствами и с тем, что называется "человеческим фактором". ПЦР — высокотехнологичный метод, требующий соблюдения строжайших правил устройства и оснащения лаборатории. Это связано с тем, что в воздухе постоянно присутствует невероятный коктейль из фрагментов ДНК всевозможных живых организмов.
И если в процессе подготовки к проведению реакции, образец будет загрязнен — возможно «ложное срабатывание». С другой стороны, далеко не всегда положительный результат ПЦР означает наличие заболевания. Например, человек пролечился от какого-либо заболевания, но погибший и уже не опасный возбудитель фактически его останки будет еще некоторое время находиться среди клеток крови и "разбираться на запчасти" защитной системой организма. Если в этот момент сделать ПЦР — результат окажется положительным. Другой вариант — это отрицательный результат ПЦР при наличии даже явной клинической картины. Одна из наиболее возможных причин — материал для исследования был взят «не оттуда». Образец должен брать квалифицированный врач, строго следуя инструкции, которую ему дает лаборатория. При создании праймеров используют специфичный для данного микроорганизма фрагмент ДНК, наименее подверженный изменениям. Он выбирается из так называемой высоко консервативной области ДНК.
Но изменчивость микроорганизмов может приводить к тому, что некоторые генотипы или штаммы исследуемого возбудителя могут приобретать и накапливать мутации в амплифицируемом клонируемом участке генома, и становиться неуловимыми для данного праймера, и тест-системы, в целом.
Биологический материал для мужчин и женщин — кровь или мазок. Для выявления микоплазмы целесообразнее брать мочу или соскоб. Но нужно учитывать, что точность уретрального или влагалищного мазка превосходит исследование мочи. Востребованным является ПЦР 6, в который входит хламидиоз , уреаплазмоз , микоплазмоз ДНК mycoplasma genitalium и mycoplasma hominis , гарднереллез , трихомониаз. Показания Анализ ПЦР на ЗППП назначают для дифференциальной диагностики при появлении следующих симптомов: боль внизу живота, в том числе во время полового акта; специфические выделения из влагалища: желтые, серые, зеленые, гнойные, пенистые, водянистые, с неприятным запахом и т. ИППП могут протекать бессимптомно, особенно у мужчин. Но даже при бессимптомном течении их нужно лечить, поскольку они провоцируют возникновение тяжелых осложнений. Показанием к молекулярной диагностике методом ПЦР в урологии и гинекологии является: воспаление шейки матки, простаты, уретры, органов малого таза; бесплодие у мужчин и женщин; эректильные нарушения. Анализ на скрытые инфекции требуется после незащищенного полового акта с постоянным при наличии симптомов ЗППП или незнакомым партнером, на этапе подготовки к беременности , а также по окончанию лечения половых инфекций.
Вирусы, как ВПЧ или генитальный герпес не поддаются лечению. Бактериальные и грибковые инфекции излечимы.
Анализ проводят по биоматериалу, взятому из носа или зева пациента.
Сюда клетки вируса попадают первым делом, поэтому тест будет эффективен с первых дней. Мазок берут в клинике, но само лабораторное исследование проводится в Государственном научном центре дерматовенерологии. Для проверки на вирус используется тест-система от этого же Государственного научного центра дерматовенерологии.
Результаты анализа можно получить через 3 дня. Возможно бесконтактное проведение процедуры вам передают набор для взятия мазка и вы потом передаете его так же бесконтактно медикам. ПЦР-тест позволяет установить, что инфекция находится в организме в данный момент.
В заключении будет лишь указано, выявлен возбудитель или нет. Вы не сможете узнать стадию и наличие антител, которые свидетельствуют о том, что человек уже переболел COVID-19. Для этого предназначен тест на антитела.
Какую информацию дает тест на антитела Тест на антитела проводят иммуноферментным методом по анализу крови из вены тоже в лаборатории Государственного научного центра дерматовенерологии. При этом определяют не наличие самого вируса, а наличие антител к нему.
Сколько стоит сдать ПЦР-анализ
«Положительный результат ПЦР-тестирования в абсолютном большинстве случаев говорит о наличии вируса на слизистой оболочке носоглотки и возможности его передачи окружающим, — говорит Татьяна Руженцова. 1. Как быстро будет готов результат ПЦР-теста? После того как у человека взяли мазок, у лаборатории есть 24 часа на доставку материала на исследование и ещё 24 часа – на проведение исследования и выдачу результата. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — высокоточный метод диагностики заболеваний, основанный на копировании ДНК или РНК патогена в пробе. Содержание. ПЦР (полимеразная цепная реакция) – достижение молекулярной биологии, одна из главных методик клинической лабораторной диагностики конца 20-го и начала 21-го веков, приносящая огромную пользу в различных областях медицинской науки. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – это метод молекулярно-генетической диагностики, позволяющий обнаружить в организме человека различные инфекционные заболевания. ПЦР расшифровывается как полимеразная цепная реакция.
ПЦР-тестирование: как работает метод ПЦР в диагностике
ПЦР (полимеразная цепная реакция) – это прямой метод выявления возбудителя, то есть с помощью него можно определить РНК вируса со слизистой ротоглотки или носоглотки, то есть можно определить сам коронавирус. Положительный анализ ПЦР – что это значит? На ранних стадиях болезни получить положительный результат значительно выше. «После четвертого-пятого дня болезни вероятность обнаружить вирус в носоглотке снижается, а респираторные симптомы могут быть в это время в самом разгаре. ПЦР или, иначе, полимеразная цепная реакция – это современный высокоинформативный метод молекулярно-генетической диагностики, активно применяемый для выявления у человека различных инфекционных и наследственных заболеваний.