ПЦР (полимеразная цепная реакция) – это прямой метод выявления возбудителя, то есть с помощью него можно определить РНК вируса со слизистой ротоглотки или носоглотки, то есть можно определить сам коронавирус. ПЦР тест на коронавирус – это анализ полимеразной цепной реакции (PCR), который проводится с помощью взятия мазка со слизистой рта и носоглотки и позволяет диагностировать даже бессимптомное течение болезни. ПЦР (полимеразная цепная реакция): что это, показания к анализу, виды тестов и методы диагностики, преимущества и недостатки. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – молекулярно-генетический анализ.
Различие тестов на коронавирус
— Ложноположительный результат — это когда пациент не инфицирован коронавирусом, но лаборатория выдала положительный результат теста на SARS-CoV-2 методом ПЦР. На ранних стадиях болезни получить положительный результат значительно выше. «После четвертого-пятого дня болезни вероятность обнаружить вирус в носоглотке снижается, а респираторные симптомы могут быть в это время в самом разгаре. Положительный результат ПЦР теста означает, что пациент в настоящее время инфицирован определенным патогеном. На ранних стадиях болезни получить положительный результат значительно выше. «После четвертого-пятого дня болезни вероятность обнаружить вирус в носоглотке снижается, а респираторные симптомы могут быть в это время в самом разгаре. Госпитализированы в основном потому, что положительный ПЦР.
ПЦР-исследования
Результат ПЦР-диагностики может быть либо положительным, либо отрицательным. Положительный результат говорит о том, что в организме человека обнаружены следы инфекции, причем именно в данный момент времени. Полимеразная цепная реакция — метод, позволяющий обнаружить конкретный генетический материал в образце. Аббревиатура ПЦР расшифровывается как полимеразная цепная реакция. ПЦР — это полимеразная цепная реакция. это крайне чувствительная вещь, то он не отличает живой вирус от мертвого. О частоте ложно-положительных результатов диагностического теста можно судить по показателю, который называется специфичность.
Как определить коронавирус или что такое анализ ПЦР?
ИФА-тестирование намного доступнее. Показания к проведению ПЦР-диагностики появление у пациента признаков, типичных для коронавирусной инфекции; воспаление легких как возможное осложнение инфекции; работа медицинских работников в отделениях, где лечат больных с коронавирусной инфекцией; деятельность патологоанатомом или работа в судебно-медицинском бюро; в период подготовки к проведению хирургической операции. Эти лица входят в перечень лиц, подлежащих обязательному тестированию. Все желающие, которые не входят в эту группу, могут сделать ПЦР-тест по своему желанию в медицинских центрах и клиниках.
ПЦР-тест требуют при въезде в большинство стран как подтверждение отсутствия инфицирования. Положительный результат ПЦР-тестирования позволяет своевременно выявить заболевание, назначить нужное лечение и добиться изоляции пациента, что сохранит других людей от риска заражения. Ее наносят на тест-полоску для анализа наличия антител.
Обнаружение IgM указывает на то, что человек болеет коронавирусом или же переболел им относительно недавно. Наличие IgG свидетельствует о том, что инфицирование произошло давно и иммунитет практически отсутствует. Но даже высокий титр антител не является гарантией защиты от повторного инфицирования.
При сдаче ИФА-теста следует соблюдать некоторые предосторожности. Нельзя принимать пищу и курить в течение 2-3 часов, предшествующих проведению тестирования. Отрицательный результат ИФА указывает на отсутствие иммунитета.
Анализ определяет возбудителя, а не реакцию организма на него. Выходит, что можно поставить точный диагноз, когда болезнь еще никак себя не проявила. Для анализа подходит большинство разновидностей биоматериала — слизь, моча, кровь, сыворотка, мокрота, эякулят, соскоб эпителиальных клеток, гной, жидкости из абсцессов.
Особенности применения ПЦР-теста Метод используют везде, где нужен быстрый, точный и надежный результат. Возбудители многих инфекций имеют несколько штаммов, поэтому точная диагностика гарантирует и эффективность лечения. Анализ проверен временем, тщательно апробирован клинически, поэтому его часто назначают в качестве дополнительного обследования, чтобы выявить определенный тип вируса или микроба.
Кроме медицины метод нашел применение в генетике, криминалистике, археологии. ПЦР-диагностика играет ведущую роль в выявлении неврологических и урологических заболеваний. Использование передовых технологий позволяет: определить причины острых уретритов — берут соскоб клеток из мочеиспускательного каналы у мужчины или женщины, влагалища, цервикального канала; диагностировать циститы, особенно хронические — через мочу или соскоб из шейки мочевого пузыря; тщательно обследовать простатит — берется секрет простаты; определить воспалительные заболевания головки полового члена и крайней плоти — соскоб клеток высыпаний; диагностировать ряд кожных патологий.
В гинекологии ПЦР-анализы — обязательная диагностическая процедура, входящая в профиль обследований различных женских патологий. В первую очередь это диагностика широкого спектра заболеваний, передающихся половым путем. Врач может назначить анализ при подозрении на хламидиоз, гонорею, герпес, вирусы папилломы человека.
Что делать, если пришел положительный ПЦР анализ? К сожалению, симптомы некоторых заболеваний не всегда видны, и в организме человека таятся скрытые инфекции. После получения положительного результата ПЦР, не стоит сразу паниковать и волноваться. Существует вероятность ложно-позитивной реакции ПЦР. В подобной ситуации необходимо повторно выполнить данный анализ. Если при первом диагностировании сдавался ПЦР качественный, то при повторном рекомендуется проходить ПЦР количественный. Выполняйте ПЦР анализы в лаборатории при профильной клинике. Если анализ транспортируется в сетевую лабораторию, велика вероятность накладок. Если диагноз подтвердится, необходимо обратится к профильному специалисту для проведения комплексного лечения.
Возможные причины ложноотрицательных результатов По словам Натальи Гасиловой, здесь основная причина кроется в чувствительности тест-системы, которая применяется в конкретной лаборатории. Она позволяет выявлять вирус как у бессимптомных и контактных в начале развития инфекции, так и в конце заболевания — уже на этапе выздоровления. Но если в образце количество вируса будет меньше порога чувствительности, то лаборатория выдаст ложноотрицательный результат, — поясняет эксперт. Еще на результат влияет корректность взятия биоматериала со слизистой оболочки носо- и ротоглотки: к примеру, мазок взяли только из зева, а надо еще и из носа. Повлияет на него также малая вирусная нагрузка в биоматериале — когда тест выполняется в самом начале болезни или, наоборот, практически при выздоровлении, когда вирус уже уходит из организма. Читайте также «Зимой в лесу грибов нет». Эксперт НИИ Пастера объяснил, почему при пневмонии тест на «ковид» бывает отрицательным Ложноотрицательный результат можно получить при нарушении рекомендованного срока хранения взятого образца — со временем вирус начинает разрушаться, а его РНК «деградирует». Общая причина, объясняющая как ложноположительные, так и ложноотрицательные результаты может скрываться в ненадежной системе идентификации образцов.
Результаты ПЦР диагностики
Но суть теста от этого не меняется, это обычная ДНК-диагностика. В подавляющем большинстве случаев она основана на методе ПЦР — полимеразной цепной реакции. Это самый надежный метод ДНК-диагностики, золотой стандарт определения вирусных инфекций. В среднем исследование занимает 3-4 часа. Но поскольку надо доставить образец в лабораторию, зарегистрировать его и пр. Как правило лаборатории заявляют, что выполнят тест от 8 часов до 2-3 дней. Если некоторые лаборатории заявляют, что «Результат будет сегодня», а другие обещают это только через 3 дня, это связано не с продолжительностью собственно анализа, а с логистикой обработки биоматериала. Более-менее все они одинаковы по своей чувствительности и специфичности.
Хотя самые первые тесты, рекомендованные к применению в феврале, отличались немного пониженной чувствительностью. Кроме того, есть и фактор «врача»: в одном случае у пациента могли взять побольше вируса и его система «увидела», в другом — в пробирку попало меньше вирусных частиц, и ответ был ложно-отрицательным. Он включает несколько этапов. Первый этап -высвобождение нуклеиновой кислоты из вируса занимает минут 30-40 , потом идет этап обратной транскрипции — превращение РНК в ДНК и ПЦР-амплификации 1,5 часа.
Вот почему так важно взять «чистый», без посторонних примесей анализ, а тест проводить очень аккуратно. Учитывая перечисленные способности полимеразной цепной реакции, можно догадаться, почему она так легко отличает уреаплазму от микоплазмы , или каждую из них от хламидии. Таким образом, даже если среди миллионов клеток человеческого организма затеряется не сам живой вирус, а лишь частица его ДНК, то ПЦР, если ей ничто не помешает, пожалуй, справится с задачей и сообщит о пребывании «чужака» положительным результатом. В этом суть ПЦР и ее основное достоинство. Достоинства и недостатки К лаборатории, осуществляющей ПЦР-диагностику, предъявляются высочайшие требования в плане оборудования, тест-систем и квалификации медицинского персонала. Это высокотехнологичная лаборатория, располагающая арсеналом высокочувствительных и высокоспецифичных реагентов, поэтому особых недостатков она не имеет. Разве что выдает положительный результат при отсутствии клинических проявлений и тем самым ставит лечебника перед дилеммой: стоит начинать лечение или нет? Врач, наблюдающий пациента, начинает сомневаться в достоверности результатов тестирования, поскольку никаких признаков заболевания не видит. Но все же, учитывая высокую чувствительность ПЦР-системы, следует помнить, что она обнаруживает возбудителя даже в доклинической стадии, а положительный результат в таком случае является скорее достоинством, чем недостатком. Исходя из этого, лечащий врач должен сам принять решение о целесообразности терапии, взяв во внимание и другие аргументы «за» и «против». Например, при диагностике хламидийной инфекции, где ПЦР относится к основным методам, наряду с хламидией, можно обнаружить и нейссерию гонококк — возбудитель гонореи. Причем, на достоверности результатов это негативно не отражается; Тестирование методом ПЦР выявляет опасные микроорганизмы в инкубационном периоде, когда они еще не успели нанести ощутимый вред организму, то есть, ранняя диагностика предупреждает о грядущем развитии патологического процесса, что дает возможность подготовиться к нему и принять во всеоружии.
При случайном незащищенный половом контакте только ПЦР поможет поставить диагноз на ранней стадии, если человек заразился каким-либо заболеванием. А также женщины, только планирующие беременность. Хотя ПЦР является максимально эффективным методом диагностики, зацикливаться только на нем не стоит. Обследование пациента при любом заболеваний должно носить комплексный подход. Если цепная полимеразная реакция позволяет выявить возбудителя, то серологическое исследование позволяет оценить эффективность лечения, реакцию организма на возбудителя и лекарства. Назначать все исследования должен врач по показаниям. Увидеть, как выполняется анализ крови ПЦР, вы сможете, просмотрев данный видео-обзор: Гудков Роман, врач-реаниматолог 67 голос.
Альтернативой может стать анализ крови. Также исследование не проводят во время местной или общей антибактериальной терапии. Подготовка к ПЦР При взятии крови достаточно не употреблять утром пищу. Исследование проводится натощак. Анализ ПЦР урогенитального мазка предполагает соблюдение следующих рекомендаций: в течение 2-3 дней воздержаться от половой жизни, не спринцеваться, не пользоваться вагинальными препаратами и тампонами, средствами для интимной гигиены с антисептическим действием; после трансвагинального УЗИ, кольпоскопии или биопсии должно пройти не менее 2 дней; в день исследования подмыться теплой водой без применения моющих средств. Соскоб из уретры у мужчин берут не ранее, чем через 2 часа после последнего мочеиспускания. Женщинам анализ следует делать до менструации или через 2-3 дня после ее окончания. Несоблюдение правил подготовки и прием антибиотиков влияют на достоверность исследования. Как сдать ПЦР 12? Сдать анализы на скрытые инфекции можно в частном многопрофильном диагностическом центре, государственной поликлинике, женской консультации по месту проживания. Как берут анализ, если материалом является урогенитальный соскоб?
Диагностика COVID-19: обзор основных методов
Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR) — это точный метод лабораторной диагностики, который используют для выявления возбудителей инфекционных заболеваний. ПЦР (метод полимеразной цепной реакции) — экспериментальный метод, использующийся при лабораторной диагностике многих инфекционных заболеваний и позволяющий обнаружить большинство микроорганизмов. — Ложноположительный результат — это когда пациент не инфицирован коронавирусом, но лаборатория выдала положительный результат теста на SARS-CoV-2 методом ПЦР.
Что такое ПЦР тест на коронавирус и как правильно сдавать мазок
Чувствительность ПЦР-анализа составляет 10-1000 клеток в исследуемом образце к примеру, чувствительность иммунологических и микроскопических тестов - всего 103-105 клеток. Методика позволяет выявлять несколько возбудителей из одной биологической пробы. Полное исследование проводится за 4-4,5 часа, реже — несколько дольше. Примером доклинической диагностики будет обследование в инкубационный период с момента заражения до возникновения жалоб больного , а также латентная инфекция когда симптомов нет совсем, а есть только лабораторные данные — ПЦР, к примеру. Одним из важных моментов ПЦР-диагностики является проведение ПЦР в архивном материале или биологических остатках, что важно для идентификации личности или отцовства. В настоящее время ПЦР-диагностика подвергается существенному развитию. Происходит совершенствование самого метода, вновь и вновь появляются новые разновидности ПЦР, на медицинский рынок поступают новые тест-системы для данной реакции. Благодаря этому стоимость ПЦР-исследований с каждым годом становится доступнее для широкого круга пациентов. В ходе исследования копируется только тот участок, который подходит под заданные условия, и только в ситуации присутствия его в исследуемой пробе. Например, материал для исследования, в котором предполагается наличие фрагментов ДНК или РНК возбудителя слюна, кровь, моча, выделения из половых органов , помещается в специальный реактор амплификатор. Далее к нему добавляются специфические ферменты, которые связываются с ДНК или РНК патогена, и происходит синтез ее копии.
Это копирование идет в несколько этапов по типу «цепной реакции», и в конечном итоге из одной копии генетического материала могут образоваться сотни и тысячи копий. Затем идет анализ и сравнение результата с имеющейся базой данных о строении различных возбудителей.
В случае ПЦР биоматериал берут дважды, через нос и через рот, смешивают с физраствором и отправляют в лабораторию. Все исследование занимает около трех часов, рассказывает технолог подразделения молекулярно-генетических исследований лаборатории Маргарита Абрамова. Если результат положительный — его повторяют, и только в случае двойного положительного результата пациенту сообщают о болезни.
МедКоллегия www. Обнаружение инфекции заключается в нахождении фрагментов ДНК дезоксирибонуклеиновой кислоты патогенного микроорганизма или его штаммов в крови, слюне, соскобе эпителиальных клеток, спинномозговой жидкости и других биологических жидкостях. ПЦР может быть положительна как на «мертвую» инфекцию, так и на активную инфекцию.
Важно выбрать правильное время взятия биоматериала и выполнить правила подготовки к тесту. В частности, это касается и нового коронавируса, который присутствует в выделениях носоглотки и ротоглотки только в течение определенного времени, по истечении которого анализ окажется отрицательным. Кроме того, высокая чувствительность ПЦР может иногда превращаться из преимущества в недостаток. Показания к проведению ПЦР-анализа ПЦР-тесты используются для: диагностики инфекционных заболеваний, вызванных вирусами, бактериями и грибами, в том числе для определения возбудителей ряда урогенитальных инфекций; определения патологических генетических нарушений; определения роста и развития раковых клеток. ПЦР тест также можно использовать для прямой диагностики наличия заболевания и мутаций в развивающемся эмбрионе. Например, впервые ПЦР была использована таким образом для диагностики серповидно-клеточной анемии путем обнаружения мутации одного гена. Как проводится ПЦР-анализ Метод полимеразно-цепной реакции постоянно развивается. Самым распространенным на сегодня является тест в реальном времени, с помощью которого можно определить исходное количество копий ДНК РНК. ПЦР с вложенной парой праймеров гнездовая проводится в две стадии для снижения вероятности амплификации неспецифичных участков ДНК. Инвертированная ПЦР используется в случае, когда нужно выяснить природу неизвестных участков ДНК, окружающих известный. Это только часть методов ПЦР, количество которых постоянно пополняется новыми технологичными вариантами. Для проведения анализа биоматериала с помощью ПЦР необходимо обеспечить его правильное взятие.