Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) обладает высокой специфичностью при выявлении РНК SARS-CoV-2. О том, как берутся образцы биологического материала и подготовке к сдаче анализа читайте в нашей статье. Оценивать результаты реакции должен практический врач, который лечит конкретного больного. Если результат положительный — его повторяют, и только в случае двойного положительного результата пациенту сообщают о болезни. Тут, помимо положительного и отрицательного результата, есть еще и сомнительный — это когда человек только заболевает и белок еще не выработался в нужных для определения объемах. Полимеразная цепная реакция: описание метода диагностики, показания, преимущества, подготовка, сроки, стоимость. Пройдите ПЦР в клинике ПрофМедЛаб.
ПЦР-тестирование: как работает метод ПЦР в диагностике
Даже обломки нуклеиновых кислот, остающиеся после инфекционного агента по окончании терапии специфическими антибактериальными препаратами, будут давать положительные результаты анализов ПЦР. Для получения максимально достоверных результатов важен правильный забор биологического материала. Он должен исключать загрязнение инородными инфекционными агентами. ПЦР положительный чаще всего фиксируется в период клинических симптомов разгара болезни. В случае носительства возбудителя, а также до трех-шести месяцев после проведения лечения и эрадикации возбудителя. Нередко встречается и ложноположительные результаты ПЦР сразу после лечения.
Когда разрушенные участки генетического материала уже погибшего возбудителя еще сохраняются в крови или биологических средах. Результат становится отрицательным по истечении шести-девяти месяцев после терапии. Какой врач проводит расшифровку ПЦР-исследований Первично назначается анализ либо венерологом, либо урологом, либо гинекологом для женщин. Оценка анализа и выставление результатов в бланке ответа — это функция врача-лаборанта, проводившего исследование.
Заведующая лабораторией молекулярной диагностики «Инвитро» в Москве Наталья Гасилова объяснила «Доктору Питеру», какие причины могут повлиять на результат в процессе тестирования.
К примеру, за несколько часов до взятия мазка не рекомендуется есть и пить, пользоваться спреями для горла и носа, а также чистить зубы и красить губы. Всё это, по словам специалистов, может повлиять на правильность результата. Заведующая московской лабораторией молекулярной диагностики «Инвитро» Наталья Гасилова назвала «Доктору Питеру» еще несколько причин, которые могут приводить к выдаче ложных результатов ПЦР-теста. Ложноотрицательный — когда человек на самом деле инфицирован, но лаборатория выдает «-». Как получают ложноположительные результаты?
Основная причина — так называемая кросс-контаминация, перекрестное загрязнение одного образца содержимым другого. Это может произойти на любом этапе тестирования — взятии мазка, транспортировки или уже в лаборатории.
Врачи говорят, что к такому развитию событий может привести сочетание множества факторов, в том числе может говорить о проблемах с иммунитетом в целом. Мы можем каким-то образом облегчить симптомы заболевания коронавирусом, но выздоровление идет за счет сил самой иммунной системы человека, — считает иммунолог Владимир Болибок. Иммунолог Николай Крючков считает, что продолжительное выявление коронавируса у уже, казалось бы, выздоровевшего человека может говорить о том, что организм не может эффективно подавить вирус — недостаточно синтезирует IgA в слизистых, позже реагирует специфический иммунитет. Это нужно иметь в виду, потому что человек может оставаться заразным. Врач-инфекционист Андрей Поздняков говорит, что при положительном тесте, который приходит на протяжении долгого времени, есть вероятность, что это РНК уже инактивированного вируса, но ПЦР-методика не может дифференцировать РНК «неживого» вируса от РНК жизнеспособного. Поэтому определить, заразен ли человек при получении положительного результата ПЦР, не представляется возможным.
Поэтому единственной гарантией от дальнейшего распространения вируса в данном случае может служить продолжение изоляции.
Правила подготовки к процедуре забора мазка Врач должен взять мазок из ротоглотки и носоглотки. Мазки со слизистой оболочки носоглотки и ротоглотки собираются в одну пробирку для большей концентрации вируса при его наличии. Пациенту за 3-4 часа до взятия мазка нельзя есть, пить, чистить зубы, полоскать рот и горло, использовать спрей-освежитель для ротовой полости, жевать жевательную резинку, курить.
Кроме того, нельзя промывать нос, использовать спреи, капли, мази для носа. Это позволит сохранить для исследования максимально возможное число пораженных вирусом клеток эпителия наружного слоя верхних дыхательных путей. Интерпретация результатов «Обнаружено» — результат говорит о наличии РНК вируса в пробе биоматериала пациента, то есть человек инфицирован коронавирусом, заразен для окружающих. В случае получения в лаборатории положительного теста результат выдается как «первично положительный», а биоматериал передается для проведения подтверждающего теста в референсный центр Роспотребнадзора.
Результат первичного тестирования может быть как подтвержден, так и не подтвержден референсным центром. При получении первично-положительного результата пациенту необходимо соблюдать режим самоизоляции до получения результата подтверждающего теста. Формулировка «обнаружено» в результате подтверждающего теста означает, что исследование пробы пациента выполнено дважды, первично положительный результат подтвержден дополнительным исследованием в референсном центре.
Что такое анализ крови на ПЦР, и зачем он нужен
Рекомендации врача 23. Однако стоит отметить, что все методы, позволяющие в лабораторных условиях обнаружить инфекцию и заболевание, не дают результатам стопроцентной достоверности. Поэтому если вы все же получили положительный результат, не стоит паниковать и бежать в аптеку за лекарствами. Врачи советуют сделать повторный анализ, который с большей долей вероятности поможет установить точный диагноз. Что делать при положительном тесте на коронавирус Положительный тест на коронавирус указывает на то, что пациент болен, является носителем опасного вируса и может заразить окружающих при тесном контакте. Что делать, если пришел положительный результат анализа COVID-19 О результатах проведенного тестирования пациент может узнать из электронного письма, СМС-сообщения или зайти на сайт клиники, где будут выложены данные. На результаты тестирования и последующие действия влияют два фактора: 1. Метод, с помощью которого был проведен лабораторный анализ. На сегодняшний день золотым стандартом в диагностике коронавирусной инфекции является ПЦР-тест. Дополнительным методом диагностики является иммуноферментный анализ, позволяющий определить наличие в крови антител, вырабатываемых иммунитетом к конкретному возбудителю. Если результаты ПЦР-диагностики положительные, это говорит о том, что человек на данный момент болен и является носителем инфекции, распространяя ее на окружающих.
Самочувствие пациента. Если анализ теста на коронавирус положительный, но самочувствие пациента нормальное, он все равно является носителем COVID-19. Поэтому чтобы инфекция не распространялась, человек должен строго соблюдать правила двухнедельной самоизоляции.
Осуществляется амплификация многократное удвоение этого участка до объема, оптимального для визуализации. Изучаются визуализированные фрагменты. Если при копировании участка ДНК в нем продолжает появляться вирус, значит, пациент заражен.
Получить результаты ПЦР-теста можно через несколько дней. Во время ожидания особенно при наличии симптомов лучше соблюдать самоизоляцию. Сегодня это наиболее достоверный диагностический метод. Риск получения ошибочного результата Вероятность получения ложноположительного результата невелика. Вирус может попасть в биоматериал пациента извне при условии нарушения санитарных правил. Поэтому проходить обследование лучше в надежных лабораториях, где подобное исключено.
Ложноотрицательные результаты встречаются чаще. Во избежание их получения перед забором биоматериала нельзя курить и дезинфицировать носоглотку антисептиками. Исказить клиническую картину также могут: ошибки медработника при взятии мазка; забор материала на поздней стадии, когда концентрация вируса минимальна; отсутствие микроорганизмов в носоглотке. Последнее возможно, если коронавируса там не было изначально попал в организм иным путем, например, через кровь. Бывает, что в носоглотке возбудитель не оседает, а сразу продвигается в легкие и выявляется только на компьютерной томографии. Экспресс-тест на коронавирус Экспресс-тест можно сделать в домашних условиях.
Он не предполагает лабораторных исследований, не требует специального оборудования. Достаточно купить набор в аптеке. Например, к Standard Q Covid-19 прилагается подробная инструкция. Для проведения экспресс-теста на коронавирус понадобятся: стерильный тампон человек берет у себя мазок сам ; одноразовая кассета в индивидуальной упаковке; пробирка с реактивом; насадка с капельницей. При наличии инфекции в организме контакт биоматериала с реактивом приводит к окрашиванию контрольной полоски. Результат появляется через 20-30 минут.
Наибольшую точность тест показывает в первую неделю после заражения.
Но спустя месяц откровенно заявляю: это больше не смешно и невозможно» По ее словам, симптомы давно прошли — еще в августе, лечение закончилось тогда же. Людмила говорит, что не смогла получить ответа от врача ни на вопрос о том, почему так происходит, ни на вопрос, как долго она будет считаться ковид-положительной. Такая же ситуация у другого пациента — Ивана. Симптомы болезни прошли в течение недели, после этого он сдал повторный тест, но тест показал, что он всё еще заразен. В окружении уже все выздоровели, однако он до сих пор не может вернуться к работе — тесты продолжают давать положительный результат. Врачи говорят, что к такому развитию событий может привести сочетание множества факторов, в том числе может говорить о проблемах с иммунитетом в целом. Мы можем каким-то образом облегчить симптомы заболевания коронавирусом, но выздоровление идет за счет сил самой иммунной системы человека, — считает иммунолог Владимир Болибок.
Подготовка к сдаче материала и проведению ПЦР-диагностики Практически все пациенты, которым проводится ПЦР-диагностика, вправе рассчитывать на достоверный, точный и быстрый результат, зависящий в большой степени от возможности лаборатории, профессионализма врача-лаборанта. Вместе с тем, многие не задумываются, что эта самая достоверность во многом зависит и от нас самих, а именно от рекомендаций лечащего доктора, образа жизни и правильности забора материала. При заборе материала требуются условия, исключающие контаминацию загрязнение материала и, соответственно, ставящие под сомнение объективность анализа. Правильная подготовка к сдаче материала не представляет особых сложностей. Существуют следующие рекомендации врачей для пациентов: 1 не жить половой жизнью за сутки до сдачи материала; 2 кровь для исследования сдается утром натощак не есть, не пить ; 3 при сдаче мочи собирается первая утренняя порция в чистый стерильный контейнер. Сроки готовности ПЦР-анализа Окончательный результат готов через 1,5-2х суток после сдачи материала. В некоторых случаях результат готов в первый же день. Расшифровка результатов ПЦР Отрицательный результат ПЦР указывает на то, что в исследуемом материале на момент его сдачи не обнаружено никаких следов инфекционных агентов. Большинство случаев показывает отсутствие инфекции, которую пытались найти в исследуемой пробе. Положительный результат ПЦР указывает на выявление следов инфекции в исследуемой биологической пробе. С большой точностью положительный результат указывает на наличие инфекции в данный момент времени. Существуют ситуации, когда ПЦР оказывается положительной, а об активной инфекции говорить нельзя — это так называемое «здоровое носительство» без клинических симптомов болезни, которое не требует лечения, но требует динамического наблюдения у врача. Наблюдается чаще при ряде вирусных инфекций ВПЧ, ЦМВИ, ВЭБ-инфекция, герпетическая инфекция и другие в таких материалах как слюна, соскоб цервикального канала, уретры, то есть из местного очага.
«Вероятность обнаружить вирус снижается». Когда нужно сдавать ПЦР-тест
Результат оценивается либо положительно, когда бактерия или вирус выявляются в исследуемом образце, либо отрицательно, что означает отсутствие инфекции в организме. Точность метода. Подробное описание: что такое ПЦР-тест на ковид, что показывает и как узнать результат. Как проводится забор биоматериала, как подготовиться. Положительный результат ПЦР-тестирования позволяет своевременно выявить заболевание, назначить нужное лечение и добиться изоляции пациента, что сохранит других людей от риска заражения. Полимеразная цепная реакция почти для каждого из нас стала обыденностью, даже если этот каждый никогда и слов таких не слышал.
Положительный ПЦР-тест на коронавирус после выздоровления, как правило, не опасен
читайте в медицинском журнале клиники Адмиралтейские Верфи. Полимеразная цепная реакция, или ПЦР, используется для диагностики язвы желудка, колита, энтерита. диагностика гепатитов. В случае получения в лаборатории положительного теста результат выдается как «первично положительный», а биоматериал передается для проведения подтверждающего теста в референсный центр Роспотребнадзора. Тест на полимеразную цепную реакцию (ПЦР) на COVID-19 – это молекулярный тест, который анализирует ваш образец верхних дыхательных путей в поисках генетического материала SARS-CoV-2. Если человек сдал тест на коронавирус, а результат оказался положительным, то это означает, что он является носителем вируса, в данный момент болеет COVID-19 или уже вылечился, но в его организме сохранились антитела.
Специалист лаборатории объяснила, почему ПЦР-тесты на коронавирус могут выдавать ошибку
Его берут из носовой пазухи — места наибольшей концентрации вируса. В случае ПЦР биоматериал берут дважды, через нос и через рот, смешивают с физраствором и отправляют в лабораторию. Все исследование занимает около трех часов, рассказывает технолог подразделения молекулярно-генетических исследований лаборатории Маргарита Абрамова.
Токарев отметил, что иногда люди бывают сверхраспространителями вируса. В таком случае ПЦР-тест всегда даст положительный результат. Ранее Дмитрий Медведев заявил, что в плане регламентирования коронавирусных ограничений и ответственности за их нарушение российское законодательство остается очень либеральным.
И очень много таких случаев, на самом деле Антон Ершов Доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор Он объяснил, что у разных людей с разной скоростью обновляются клетки слизистой оболочки носоглотки и ротоглотки, и у некоторых части погибшего SARS-Cov-2 сохраняются в верхних дыхательных путях по несколько недель.
У меня есть случаи, когда пациент был два с половиной месяца ложноположительный по ПЦР, это было в первую волну. И представляете, он измучился, не мог с карантина выйти Антон Ершов Доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор По словам практикующего врача, понять, что результат теста ложноположительный, можно на двух основаниях: отсутствие каких-либо симптомов болезни и как минимум два отрицательных ПЦР-теста в следующие несколько дней. Просто делаем нормальную санацию слизистой, очищаем её от этого всего, промываем и так далее — и потом дважды пациент ПЦР сдаёт, и он отрицательный Антон Ершов Доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор Кроме того, иногда тест находит ковидные РНК у здорового человека в тот момент, когда вирус только что оказался на слизистой оболочке и ещё не успел там обосноваться, добавил профессор.
Поэтому генетический материал разных патогенов может якобы дать ложноположительный результат при исследовании на коронавирус. Это неправда, сообщает Vecher. Несмотря на то что COVID-19 может вызвать симптомы, схожие с простудой, эти заболевания вызваны разными вирусами.
ПЦР-тест является надежным и точным методом исследования.
ПЦР диагностика: что это такое
ПЦР (полимеразная цепная реакция) представляет собой метод выявления присутствующего в организме вируса – у человека для этого берутся мазки из носа, ротоглотки. Сообщить о результате теста в медучреждение по месту жительства. Напомним, что больничные листы с подтвержденным положительным ПЦР будут открыты с момента фиксации вашего результата в системе ЕМИАС. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – это современный инструмент диагностики разнообразных инфекций, отличающийся высокой точностью. Полимеразная цепная реакция, или ПЦР, используется для диагностики язвы желудка, колита, энтерита. В свою очередь главврач клинико-диагностической лаборатории "Инвитро — Сибирь" Андрей Поздняков считает, что надолго сохраняющийся положительный ПЦР-тест может быть связан с особенностями дельта-варианта коронавируса.
Что такое анализ крови на ПЦР, и зачем он нужен
Это свидетельствует о том, что при обнаружении вирусной РНК на этой стадии люди перестают быть заразными. Поэтому Корейский центр по управлению и контролю за болезнями больше не требует изоляции в таких случаях. В общей популяции пациенты у которых была коронавирусная инфекция в течение 10-14 дней, вероятно, больше не представляют опасность для окружающих. Однако это правило может не распространяться на все категории пациентов, в частности, иммунокомпрометированных пациентов или тяжело больных пациентов, находящихся в больнице. Ann Intern Med. Troy Brown, RN.
Ученые уже десятилетия изучают свойства ДНК. Выделяют из живых организмов, синтезируют искусственно... Потому что когда его мало, то труднее ставить эксперименты - проще запороть, загрязнить чем-то чужеродным и т.
И тогда в далеком 1983м один любящий галлюциногены ученый Кэри Муллис решил использовать для этого то, что давно уже придумала природа - репликацию, только искусственную, в пробирке. Нобелевку по химии за это получил, кстати... За основу взяли все основное, что есть в "натуральной" репликации - собственно ДНК, полимеразу, свободные буквы-нуклеотиды, чтобы ей было что вставлять в новую цепь, и праймеры - затравку, которая покажет полимеразе, откуда ей начать свое грязное дело. Путем долгих манипуляций и экспериментов выяснилось, что оптимальнее всего смешать все это и поставить на определенный температурный режим, где каждый этап реакции будет происходить на своей заданной температуре. Этапа всего три: 1 Денатурация. При 95 градусах двойная спираль ДНК распадается на две нити разрушаются те самые слабые водородные связи между комплементарными нуклеотидами. При 40-60 градусах в зависимости от ряда факторов маленькие затравки находят комплементарный участок на одиночной цепи и садятся на него. При 72 градусах полимераза садится на затравку и начинает достраивать новую цепь, пользуясь старой как шаблоном.
Откуда именно 72 градуса - очень интересная история о пользе фундаментальной науки, как-нибудь в другой раз. В результате такого цикла из одной двойной спирали получаются две! Как несложно догадаться, теперь надо все это повторить еще раз, чтобы из 2 сделать 4, потом 8... Ну, вы поняли - это цепная реакция! Тем не менее, этого хватает, чтобы получить рабочие концентрации ДНК, с которыми можно уже делать серьезное дело. Аппаратная база. Бедняга Муллис и его последователи сначала использовали тупо три водяных бани с разной температурой, вручную перемещая из одной в другую ценные пробирки с реакцией. Мы на практике в универе почему-то делали так же...
Но как только мир понял, что ПЦР - это офигенно, сразу появились лабораторные приборы, которые этот процесс автоматизируют.
Использование передовых технологий позволяет: определить причины острых уретритов — берут соскоб клеток из мочеиспускательного каналы у мужчины или женщины, влагалища, цервикального канала; диагностировать циститы, особенно хронические — через мочу или соскоб из шейки мочевого пузыря; тщательно обследовать простатит — берется секрет простаты; определить воспалительные заболевания головки полового члена и крайней плоти — соскоб клеток высыпаний; диагностировать ряд кожных патологий. В гинекологии ПЦР-анализы — обязательная диагностическая процедура, входящая в профиль обследований различных женских патологий. В первую очередь это диагностика широкого спектра заболеваний, передающихся половым путем. Врач может назначить анализ при подозрении на хламидиоз, гонорею, герпес, вирусы папилломы человека.
В качестве биоматериала обычно выступают кровь, моча или вагинальный соскоб. Метод ПЦР — наиболее точный способ выявления Covid-19. Его преимущество в том, что он обнаруживает сам вирус. Подтвердить патогенного агента удастся даже при бессимптомном течении заболевания. И, наоборот, диагностика не даст положительного результата, если много антител, а самого вируса уже нет.
Для проведения теста у вас возьмут образец слизи из носа или горла. Тампон на несколько секунд оставляют на слизистой, потом поворачивают и с небольшим нажимом извлекают, далее герметично упаковывают в пробирку и отправляют на анализ. Приборная база для применения метода полимеразной цепной реакции в лаборатории обычно включает: амплификатор термоциклер ; систему для гель-электрофореза с источником питания — для визуализации результатов ПЦР; систему гель-документации — для анализа результатов; ПЦР-бокс — для пробоподготовки;.
Отрицательный и ложноотрицательный результат Однако, отрицательный результат ПЦР-анализа, к сожалению, не говорит об обратном, не исключает наличие вируса в организме. Мы можем только говорить, что вирус не обнаружен. Не обнаружен в исследуемом биоматериале, которым чаще всего является мазок из рото- или носоглотки. Почему так происходит? Потому что вирус совсем недолго находится на слизистой верхних дыхательных путей, спускаясь в бронхи и лёгкие — мишень поражения. Поэтому лучше искать его ниже — в мокроте, выделяемой при кашле, и смывах из нижних дыхательных путей бронхоальвеолярный лаваж. Участки генома вируса способны связываться с гемом, нарушая функцию гемоглобина в эритроцитах. Это мешает транспортировке кислорода клетками крови и именно гипоксия недостаток кислорода негативно влияет на лёгкие. Влияние вируса на кровь подталкивает к мысли, что именно в ней мы можем найти SARS-Cov-2 в тяжёлых клинических случаях, хотя не обнаруживаем его на слизистых верхних дыхательных путей. Мы должны научиться выделять вирус из крови. Описана даже кишечная форма короноавируса, проявившаяся тошнотой, рвотой, диареей. И искать его тогда следует в кишечнике, диарейных массах и анальных мазках. Это, кстати, дополнительный фактор, свидетельствующий о том, что вирус передаётся не только воздушно-капельным путём, но и фекально-оральным.