МОСКВА, 20 июн – РИА Новости. В России зарегистрировали новый препарат для пациентов, устойчивых к антибиотикам. Новый антибиотик получают из грибка Emericellopsis alkalina. Рассказываем, в чем особенности нового штамма «пирола», обнаруживают ли его существующие тесты и как защититься от нового варианта. Антибиотик от искусственного разума оказался эффективным против самых лекарственноустойчиых бактерий.
Искусственный интеллект нашёл новый антибиотик
Был проведен контрскрининг обучающего набора из 39,312 соединений на цитотоксичность в клетках карциномы печени человека HepG2 , клетках скелетных мышц человека HSkMCs и клетках фибробластов легких человека IMR-90. Жизнеспособность клеток измеряли после 2-3 дней обработки каждым соединением в концентрации 10 мкМ, которая соответствует и широко используется в культурах клеток человека. Как и выше, эти данные были использованы для обучения бинарных классификационных моделей, предсказывающих вероятность того, является ли новое соединение цитотоксичным для клеток HepG2, HSkMCs или IMR-90, на основе химической структуры соединения. Для ансамблей из 10 моделей Chemprop, обученных и проверенных, а затем протестированных на тех же данных, значения AUPRC для моделей составили 0,176, 0,168 и 0,335, соответственно. Это свидетельствует о положительной, но менее предсказуемой эффективности, чем у моделей для антибиотической активности, что может быть обусловлено более строгими критериями для объявления соединений нецитотоксичными. Фильтрация и визуализация химического пространства После удовлетворения эффективностью наших моделей, исследователи переобучили ансамбли из 20 моделей Chemprop на всех обучающих наборах данных, в результате чего были получены четыре ансамбля, предсказывающие активность антибиотиков, цитотоксичность HepG2, цитотоксичность HSkMCs и цитотоксичность IMR-90. Ансамбли были применены для прогнозирования антибиотической активности и цитотоксичности 12 076 365 соединений, включая 11 277 225 соединений из базы данных Mcule purchasable, в которой большинство соединений можно легко приобрести, не прибегая к собственному химическому синтезу, а также 799 140 соединений из базы данных Broad Institute. PAINS Pan-Assay Interference Compounds и Brenk substructures — это наборы подструктур, которые могут вызывать нежелательные эффекты или ложноположительные результаты в биологических экспериментах. PAINS является набором химических структурных фрагментов, которые часто обнаруживаются в молекулах, проявляющих побочную активность. Brenk substructures представляют собой схожий набор подструктур, разработанный для выявления химических групп, которые часто связаны с нежелательными свойствами молекул, такими как токсичность, незаурядность или проблемы с разработкой лекарств.
Наконец, оставшиеся соединения фильтруются на предмет структурной новизны, определяемой коэффициентом сходства Танимото — менее 0,5 по отношению к любому активному соединению в обучающем наборе данных. Коэффициент Танимото является метрикой, используемой для оценки сходства между двумя множествами или наборами данных преимущественно для молекул и генов. Коэффициент Танимото вычисляется как отношение числа общих элементов между двумя наборами к общему числу элементов в обоих наборах. Он может принимать значения в диапазоне от 0 до 1, где 0 означает полное отсутствие сходства, а 1 обозначает полное совпадение. Он позволяет отображать сложные многомерные данные на двух- или трехмерную плоскость, сохраняя при этом важные отношения и структуру в данных. Алгоритм t-SNE основывается на концепции близости объектов: близкие объекты в исходном пространстве имеют более высокие шансы быть близкими и после проекции на низкоразмерное пространство. Диаграмма с использованием алгоритма t-SNE t-distributed neighbor embedding показывает соединения с высокими и низкими оценками прогноза антибиотиков, а также соединения из обучающего набора данных при разных пороговых значениях оценки прогноза. Данная диаграмма позволяет визуализировать химическую схожесть или различие представленных соединений. Активные соединения из обучающего набора данных красные точки в основном разделяют соединения с высокими оценками прогнозов зеленые, черные и фиолетовые точки от соединений с низкими оценками прогнозов коричневые точки Особое замечание: как указано в t-SNE, несколько найденных веществ структурно отличаются от активных соединений в обучающем наборе, что указывает на то, что разработанные модели обобщаются на невидимые химические пространства.
Обоснование прогнозов классов антибиотиков Так как графовые нейронные сети делают прогнозы на основе информации, содержащейся в атомах и связях каждой молекулы, исследователи предположили, что соединения с высокими оценками прогноза антибиотической активности содержат подструктуры «обоснования» , которые в значительной степени определяют их оценки. Выявление таких обоснований обеспечило бы гарантии объяснимости модели для интересующих нас результатов. Оценка прогноза антибиотической активности для любого найденного вещества могла бы быть прямо отнесена к его обоснованию, так, что обоснование или же рационал , рассматриваемое самостоятельно как молекулярный вход в Chemprop, сразу бы обладало высокой оценкой прогноза антибиотической активности. Возможность классификации таких обоснований сделала бы прогнозы Chemprop более понятными для людей и позволила бы последующий анализ подструктур с помощью машинного обучения. Учитывая обученные модели Chemprop, удалось вычислить такие обоснования с помощью алгоритмов поиска на основе графов. Эти алгоритмы позволили определить в контексте одной молекулы наименьшее обоснование с заданным пороговым числом атомов, имеющее положительное предсказывающее значение. Исследователи стремились найти обоснования, содержащие не менее восьми атомов и проявляющие высокие предсказательные оценки антибиотической активности, превышающие 0,1, с использованием поисковых деревьев методом Монте-Карло. Поиск методом Монте-Карло включает выбор начальной подструктуры, итеративное обрезание подструктуры и выбор удалений, приводящих к высоким оценкам предсказания, когда подграфы передаются в качестве входных данных в Chemprop. Итеративное обрезание подструктуры — это метод оптимизации моделей глубокого обучения путем последовательного удаления нейронов или связей с низкой значимостью.
В начале процесса все нейроны или связи обучаются на тренировочных данных. Затем производится оценка значимости каждого нейрона или связи - например, на основе их вклада в ошибку модели или значения градиентов. После удаления происходит повторное обучение модели, чтобы компенсировать потерю ее емкости. Этот процесс повторяется, пока не достигнута желаемая эффективность модели. На рисунке показаны три возможных пути поиска от корня путем удаления периферийных связей или колец выделены оранжевым. Из-за ограничений места показаны только три шага от корня. Для предсказания активности каждого листового узла используется Chemprop, и эти предсказания используются для обновления статистики каждого промежуточного узла при обратном проходе.
Создатели антибиотика полагают, что эффективность в борьбе с патогенами и при этом более высокая безопасность в сравнении с представленными на рынке средствами сделают препараты востребованными на рынке и полезными для пациентов. У Wockhardt Bio AG остается право собственности на препараты, а «Джиэфси» займется локальными регистрационными клиническими исследованиями и получением регистраций, а также мероприятиями по маркетингу и продвижению лекарств в регионе.
Гаузе, доктор биологических наук Вера Садыкова. Его получают синтетическим путем. Микроорганизмы практически не развивают устойчивость к этому антибиотику. Его применяют как местное антибактериальное средство. По ее словам, к грамицидину С практически отсутствует резистентность, он производится на территории России и продается в аптеках. При этом сейчас в мире набирает темпы устойчивость бактерий к антибиотикам, поэтому ученые сосредоточены на разработке новых антигенов.
С помощью этих блоков и их модификаций ученые синтезировали 62 совершенно новых стептрограминов группы A. Эффективность новых соединений оценивали по их действию на 20 патогенных бактерий, обладающих устойчивостью к другим стрептограминам, при выяснили, как те или иные химические группы сказываются на эффективности антибиотиков. Несколько соединений подавляли рост большинства патогенов даже в очень низких концентрациях. Самый перспективный антибиотик, 47—VS1, проверили на эффективность против клинических изолятов золотистого стафилококка, обладающих множественной антибиотикорезистентостью, в том числе к стрептограминам. Чтобы детально описать механизм действия новых антибиотиков, ученые получили методом рентгенокристаллографии серию структур комплекса рибосомы E.
«Свежие антибиотики»: российские ученые создали новое вещество с антибактериальным эффектом
Однако реакции с ними были изучены только с простыми веществами, такими как спирты и карбоновые кислоты. Чтобы получить новые соединения, которые могут стать лекарствами, включая эффективные антибиотики, нужно исследовать их реакции с более сложными «партнёрами». В одном эксперименте учёные провели реакцию между диазоэфирами и азотсодержащими кислотами, добавив катализатор на основе золота. В результате получились молекулы оксазинона, которые обладают антибактериальными свойствами. Этот метод оказался универсальным и проще, поскольку не требует сложных многоступенчатых реакций с большим количеством реагентов. В другом эксперименте в качестве инициатора реакции использовали синий свет.
Новый отчет ВОЗ был представлен на специальной онлайн-сессии Европейского конгресса клинической микробиологии и инфекционных болезней ранее в этом месяце. Отчет основан на обзоре, опубликованном ВОЗ в прошлом году. Согласно отчету, с 2017 по 2021 год на рынок поступило всего 12 новых антибиотиков. Еще 27 экспериментальных антибиотиков, направленных против "критических" бактериальных инфекций, таких как Acinetobacter baumannii и Pseudomonas aeruginosa, находятся в стадии клинической разработки. Но только шесть из этих препаратов считаются достаточно отличающимися от существующих антибиотиков, чтобы их можно было использовать против устойчивых к лекарствам бактерий.
И только четыре разработаны с действительно уникальным механизмом действия. Некоторые из этих препаратов находятся в поздней стадии испытаний и могут скоро стать доступными для населения, другие могут не пройти тесты.
Антибиотики при «пироле» назначают лишь в том случае, если присоединяется бактериальная инфекция — в остальных случаях они бесполезны Народными средствами Помочь улучшить состояние при заражении новым штаммом «пирола» можно, используя народные — немедикаментозные — средства — теплое обильное питье, постельный режим, полоскания травяными отварами если у вас нет аллергии на травы. Вакцина от «пиролы»: помогают ли прививки «Роспотребнадзор» уже отметил, что все существующие вакцины должны защищать и от нового варианта коронавируса. Зарубежные производители также подчеркнули, что вакцинация от «пиролы» должна обеспечить эффективную защиту. Возможности для этого есть. Вопросы и ответы Пока число заболевших не так велико, а потому данных у врачей о течении заболевания немного. Чем «пирола» отличается от остальных штаммов коронавируса?
Какие осложнения могут быть после «пиролы»?
Помимо основного действия, LPC-233 показал «чрезвычайно низкий уровень спонтанных мутаций резистентности» у бактерий, подвергшихся действию препарата. Работа по поиску эффективного ингибитора фермента LpxC велась в Университете Дьюка более 20 лет — за это время учёные «перебрали» более 200 соединений. Однако именно LPC-233 показал максимальные результаты.
FDA одобрило новый антибиотик против инфекции мочеполовых путей
| Минздрав РФ исключил антибиотики из стандарта лечения ОРВИ – Москва 24, 25.04.2024 | Минздрав России утвердил новый стандарт лечения взрослых при острых респираторных вирусных инфекциях (ОРВИ). |
| Созданы антибиотики принципиально нового действия – экспертный материал, Lahta Clinic | В то же время устойчивость бактерий к антибиотикам, по его словам, нарастает «из-за снижения темпов разработки новых антибиотиков и нарушения правил применения существующих». |
Новый стандарт лечения ОРВИ в России: антибиотики исключить, но можно обратиться к гинекологу
Так ведь антибиотики применяют при бактериальном происхождении болезни (грипп). Новый антибиотик — продукт многолетнего партнерства группы Юрия Поликанова, адъюнкт-профессора биологических наук UIC, с Гарвардским университетом. В России остался один действенный антибиотик грамицидин С, а их производство в целом находится в состоянии упадка.
Российские ученые создали суперпатоген: все антибиотики бессильны
Ученые из Калифорнийского университета в Сан-Франциско на страницах Nature сообщили о получении целого ряда полностью искусственных антибиотиков группы A стрептограминов, которые эффективно подавляют рост штаммов золотистого стафилококка Staphylococcus aureus и других патогенных бактерий, устойчивых к известным стрептограминам. Стрептограминовые антибиотики подавляют синтез белка в клетках бактерий, атакуя бактериальную рибосому: соединения группы A связываются с ее пептидилтрансферазным центром и при этом повышают сродство туннеля для выхода пептида к антибиотикам группы B. Многие бактерии обладают устойчивостью к стептограминам группы A благодаря ферменту виргиниамицинацетилтрансферазе Vat , который ацетилирует антибиотики и тем самым инактивирует их. Получение новых стрептограминовых антибиотиков за счет модификации уже имеющихся пока не позволило создать соединения, которые решили бы проблему устойчивости к стептограминам. Несколько исследовательских групп за последние годы разработали подходы органического синтеза для получения полностью синтетических стрептограминовых антибиотиков группы A, однако создать с их помощью эффективные антибиотики сейчас удалось лишь одной из них.
Решение - делать отдельную программу, над которой мы сегодня работаем, и свои предложения формируем, чтобы была отдельная государственная программа по созданию новых антибиотиков для решения этой задачи.
Геннадий Красников, академик РАН Ранее сообщалось, что российские ученые создали антибиотик, который убивает микобактерии внутри макрофагов. Читать материалы по теме:.
Микроорганизмы практически не развивают устойчивость к этому антибиотику. Его применяют как местное антибактериальное средство. По ее словам, к грамицидину С практически отсутствует резистентность, он производится на территории России и продается в аптеках. При этом сейчас в мире набирает темпы устойчивость бактерий к антибиотикам, поэтому ученые сосредоточены на разработке новых антигенов. Садыкова отметила, что в НИИ по изысканию новых антибиотиков имени Г. Гаузе активно ведутся разработки и исследования новых противогрибковых и антибактериальных антибиотиков: астолидов, гауземицина, амикумацина.
Вы оформили предварительную запись на прием - понедельник, 01. Ошибка Связаться с отделом подбора кадров Прикрепить резюме Нажимая кнопку отправить, вы принимаете политику конфиденциальности Отправить Нажимая кнопку отправить, вы принимаете политику конфиденциальности Отправить Нажимая кнопку отправить вы принимаете политику конфиденциальности Отправить Напишите нам Нажимая кнопку отправить вы принимаете политику конфиденциальности и правила размещения отзывов и даете разрешение на публикацию отзыва на сайте veramed-clinic.
Созданы антибиотики принципиально нового действия
| Европейская комиссия одобрила новый антибиотик против супербактерий | Антибиотик от искусственного разума оказался эффективным против самых лекарственноустойчиых бактерий. |
| ИИ помог обойти защиту резистентных бактерий: открыт новый класс перспективных антибиотиков / Хабр | Эксперты подтвердили, что найти замену вильпрафену можно, у лекарства нет преимуществ перед другими макролидными антибиотиками, включая азитромицин и кларитромицин. |
| Больше никаких антибиотиков при ОРВИ: Минздрав утвердил новые стандарты лечения | Российские учёные создали препарат, спасающий людей от инфекций мочевыводящих путей, даже когда бессильны самые мощные существующие антибиотики. |
Созданы антибиотики принципиально нового действия
Новый антибиотик также может быть эффективен против некоторых грибков. Новый российский антибактериальный препарат широкого спектра действия Фтортиазинон поступит в оборот в июне, сообщил РИА Новости директор НИЦЭМ им. Остатков антибиотика с действующим веществом джозамицин в России хватит примерно на полгода. По словам главного внештатного уролога Дмитрия Пушкаря, он может использоваться в ассоциации с антибиотиками, а также самостоятельно, что приводит к ослаблению тех. Новый российский антибиотик фтортиазинон, вероятно, подавляет у бактерий так называемую систему секреции третьего типа.
Новые антибиотики открыли иркутские ученые
| Ученые разработали антибиотик, преодолевающий бактериальную резистентность - Hi-Tech | В ходе испытаний на мышах команда обнаружила, что новые AMP работают так же хорошо, как и существующие антибиотики, не вызывая никаких видимых признаков токсичности. |
| Новые антибиотики группы A стрептограминов получают конструированием из блоков | от 7 до 14 дней. |
| Искусственный интеллект нашёл новый антибиотик | Наука и жизнь | При этом лечение антибиотиками уменьшало распространенность и массу очагов эндометриоза у мышей. |
| Центр имени Гамалеи зарегистрировал суперантибиотик «Фтортиазинон» | Исследователи создали антибиотики нового класса, способные уничтожать широкий спектр бактерий, устойчивых к другим препаратам. |
| Появился меняющий форму антибиотик для борьбы со смертельными супербактериями | Молчащие гены являются "золотоносной жилой" в поиске новых антибиотиков для замедления продолжающегося кризиса резистентности. |
Трепещи, инфекция! Ученые создали принципиально новый антибиотик
Чашки Петри с исследуемым штаммом M. Источник: Алексей Ватлин Выяснилось, что малые дозы антибиотиков не убивали, а только укрепляли его «иммунитет», то есть, увеличивали активность основного гена-регулятора устойчивости whiB7. Так, ученые наблюдали значительное увеличение сопротивляемости микроорганизма под действием канамицина и офлоксацина. Наибольшая же сопротивляемость появлялась у него при контакте с тетрациклином. Таким образом, малые дозы сразу девяти разновидностей антибиотиков, в состав которых входят вышеназванные вещества, оказались не оружием, а «прививкой» для болезнетворного микроорганизма. По словам доцента РУДН, кандидата биологических наук Алексея Ватлина, подобные устойчивые микробы могут появляться в окружающей нас среде вследствие неконтролируемого использования антибиотиков в сельском хозяйстве, пищевом и фармацевтическом производствах. При этом, как показали опыты, они не меняют своей ДНК, — новые свойства возникают у них за счет активации генов резистентности.
В больницах таких антибиотиков осталось на полгода, сообщает издание. Вильпрафен и вильпрафен солютаб в нашей стране выпускали заводы «Ортат» и «Зио-Здоровье». В российском представительстве Astellas подчеркивают, что с отечественного рынка уходят только эти антибиотики, другие препараты компании останутся. Эксперты, опрошенные РБК, посчитали решение японской фармацевтической компании неожиданным, и обратили внимание, что джозамицин пользуется популярностью в России, а вот аналогов ему нет. В Минздраве отмечают, что лекарство можно заменить на азитромицин и кларитромицин.
Важно отметить, что, хотя CRISPR-Cas9 уже использовался для создания платформы для активации генов в таких организмах, как Escherichia coli, это первый случай его применения к Streptomyces. Исследование опубликовано в журнале Nucleic Acids Research. Они являются своего рода генетической темной материей", - говорит он. Новая стратегия лаборатории избавляет от трудоемкой задачи подвергать S. По его словам, появление технологии CRISPR, которая адаптирует механизмы иммунной системы бактерий для поиска определенных генов вдоль нити ДНК, упростило доступ к ранее скрытым кластерам генов.
Читайте «Хайтек» в Распространение устойчивых к лекарствам супербактерий, которые эволюционировали, чтобы сопротивляться действию даже самых сильнодействующих антибиотиков, представляет постоянно растущую угрозу для общественного здравоохранения. Теперь ученые изобрели новый тип антибиотика, который может уничтожать эти микробы, быстро меняя форму, перестраивая атомы. Исследователи описали первый из этих меняющих форму антибиотиков в статье, опубликованной в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.
До сих пор они тестировали препарат на личинках восковой моли Galleria mellonella , обычной животной модели, используемой для проверки эффективности антибиотиков.
Новости партнеров
- Новые антибиотики открыли иркутские ученые
- ВОЗ предупредил о потенциальном дефиците новых антибиотиков
- Как в мире разрабатывают новые антибиотики
- Искусственный интеллект нашёл новый антибиотик
- В России утвердили новый стандарт лечения простуды. Из него убрали антибиотики
Лечиться будет нечем? В России остался только один действенный антибиотик
Авторы исследования отмечают, что разработка в перспективе позволит создать новые антибиотики и антибактериальные покрытия. Открыта новая группа антибиотиков с уникальным механизмом атакующего действия на бактерии, что делает эти препараты очень перспективными, прежде всего, в контексте. Очевидно, новые рекомендации направлены на то, чтобы ограничить применение антибиотиков настолько, чтобы уменьшить развитие устойчивости к ним у бактерий”.
Минздрав исключил антибиотики и гормональные препараты из стандарта лечения ОРВИ
В итоге чтобы открыть новый антибиотик, надо перебрать около 1 млн актиномицетов, а их спонтанные мутации способны свести на нет процесс в любой момент. В первую очередь, киномицин считается более эффективной версией циклического липопептидного антибиотика даптомицина. Российские ученые впервые за 20 лет открыли новое семейство природных антибиотиков, производимых почвенными бактериями стрептомицетами.
РАН начала работу над созданием госпрограммы по новым антибиотикам
от 7 до 14 дней. Исследователи создали антибиотики нового класса, способные уничтожать широкий спектр бактерий, устойчивых к другим препаратам. В перспективе мы намерены использовать эти свойства нашего соединения для разработки новых антибиотиков", говорит профессор физической химии Анна Шиповская.